在正文開始之前，還是要介紹一下科布多和阿爾泰的歷史淵源
科布多的失守對於中國意味著什麼？科布多與新疆阿爾泰又是什麼關係？二者是如何分分合合的？
噶爾丹之地：
清代初年，科布多一帶為蒙古喀爾喀部牧地，後來被準噶爾噶爾丹大汗佔據，喀爾喀三部被迫南遷進入內地。
接收他們的康熙皇帝也承擔不了這些內遷的“黃金家族”子孫們的吃喝拉撒，想著早點把他們脫手。
噶爾丹敗死之後，三部回遷，祖傳之地又回到他們手中。
1761年（乾隆二十六年），為了保護一直抱大腿的外蒙喀爾喀三部，弘曆爺特意在阿爾泰山附近的大片地區，設定了科布多參贊大臣，統轄阿爾泰山南北、厄魯特蒙古諸部和阿爾泰烏梁海、阿爾泰諾爾烏梁海諸部的蒙古部族。
統率守城馬步兵、卡倫士兵、屯田蒙古兵、牧場兵以及嚮導兵等總計2000餘名，管轄賽音濟雅哈圖盟各部兵馬，以及扎哈沁1旗1佐領，明阿特1旗，阿爾泰及阿爾泰諾爾烏梁海9旗的兵馬。
嘉慶以後，科布多參贊大臣轄八部三十二旗。
同治及其之後：
同治七年(1868年)，置布倫托海辦事大臣、幫辦大臣各一員，轄阿爾泰山南路布倫托海(今烏倫古湖)一帶，駐地在今新疆福海縣。
同治八年(1869)布倫托海隸科布多參贊大臣。
光緒三十二年十二月(1907年1月)，置阿爾泰辦事大臣，轄阿爾泰烏梁海諸旗、新土爾扈特部、新和碩特部及哈薩克流民，駐承化寺。
從上述設定可以肯定科布多，阿爾泰至少在光緒之前都是屬於科布多參贊大臣轄地。
但在同治6年（1867年）開始，科布多，塔城就開始了對阿爾泰地區管轄權的明爭暗鬥。
為什麼會這樣呢？
這裡咱們說一個甘肅的大英雄-大喇嘛棍噶札勒參：
1862年新疆暴亂，1865年大喇嘛棍嘎札勒參還俗，組織民間武裝協助清軍，抗擊暴亂軍保護民眾。
1866年5月塔城陷落，大批厄魯特蒙古人流離失所，而清朝廷此時接到榮全“棍嘎札勒參欲赴俄國”的奏摺。
關於大喇嘛出走沙俄的訊息，沒有任何證據來佐證，當然也不排除大臣間的互相詆譭。
但清政府擔心一旦棍嘎札勒參奔赴沙俄，有可能會對沙俄入侵伊犁地區提供幫助。
清政府決定利用棍嘎札勒參來招撫當地厄魯特蒙古人眾，即可招撫安置流民，亦可利用其聲威組織力量，抵禦沙俄的入侵，可謂是兩全其美。
1867年，李雲林上奏清廷：“趁棍嘎札勒參西行之際，將厄魯特人眾全部賜予該喇嘛為徒眾，安其遊牧於額爾齊斯河一帶，該喇嘛旋迴時，必能將厄魯特和土爾扈特各旗牧一併安置，可以北御俄夷，西制哈薩克”。
他的意思是：把厄魯特這些蒙古人都送給大喇嘛，讓大喇嘛收他們當徒弟，安排他們在額爾齊斯河一帶遊牧，可以北邊防禦俄羅斯，西邊遏制哈薩克。
因塔城陷落而四處流散的厄魯特眾蒙古人到達額爾齊斯河以後，見那裡水草豐美，再也不願意離開而四處奔波。
清政府因勢利導，不顧棍嘎札勒參的拒絕，命令他在此管理各旗遊牧事宜。
因為塔城的陷落，清政府調整了塔城的領導班子並在布倫托海設立辦事大臣，幫辦大臣協助各旗遊牧及厄魯特蒙古安置事宜。
1868年，李雲林為第一任布倫托海辦事大臣，李雲林此人貪婪成性，肆意剋扣營勇菜金，銀兩。
這樣一來二去，下邊計程車兵就不幹了，於是營勇張敖，張興領導兵變。
兵變的時候李雲林不在軍營，他帶著棍嘎札勒參的部隊平息了此次兵變，克復布倫托海。
1869年9月，清廷命棍嘎札勒參的僧眾居住於阿勒台山南，俗眾居於青格力河。
1869年11月，棍嘎札勒參因身體不適請假，清廷諭旨：“棍嘎札勒參歷年帶兵剿匪，著有勞績，今因病請假，自應府如所請，著賞假一個月調理，假滿後即赴阿勒台山收集徒眾，妥辦安插各事。”
給你一個月假，休息好了再回來工作。
清政府在此地建設承化寺以安置棍嘎札勒參及徒眾。
1873年，烏里雅蘇臺將軍奎昌上奏清政府，棍嘎札勒參率徒眾回阿爾泰耕牧，而此地為烏梁海蒙古所有。
他提出：“非辦理清楚，不能彼此相安”
清政府很快就任命奎昌補佐領雅爾哈，前往阿勒臺，會同科布多委員及烏梁海兩翼散秩大臣，妥善辦理。
奎昌與烏梁海兩翼散秩大臣及棍嘎札勒參居中協調，使得雙方達成一致意見：
烏梁海請願借地，棍嘎札勒參也樂意從命。
清政府採納了奎昌的意見，從棍嘎札勒參的徒眾中抽調了800人，安置在阿爾泰山一帶遊牧。
隨後12個鄂托克的哈薩克人也來到阿爾泰一帶。
1874年，棍嘎札勒參上奏朝廷，將其部眾建議劃歸塔城參贊大臣管轄。
科塔借地
1878年新疆之亂平息，1883年7月16日，伊犁參贊大臣升泰與沙俄鄂木斯克軍區參謀長巴布科夫簽訂《中俄科布多界約》，劃分科布多，塔城地界。
科布多要求驅除棍嘎札勒參並要求歸還借地-阿爾泰。
科布多歷任大臣均向清廷提出歸還借地的請求。
隨著沙俄入侵的腳步的步步逼近，阿爾泰在防禦沙俄入侵方面的作用越來越重要。
伊犁將軍長庚在查勘阿爾泰山後，清廷做出了歸還阿爾泰山與科布多的決定。
長庚認識到，清廷在阿爾泰山沒有設官管理，易為沙俄趁虛而入，於是在1903年12月，向朝廷上奏《籌擬阿勒台山防守事宜折》：
提出固疆域，修守備，重巡防，輯哈部四項理由。
1904年4月12日，清廷任命錫恆為科布多辦事大臣，駐紮阿爾泰，處理蒙哈事宜。
1906年錫恆上奏在阿爾泰設立獨立軍鎮，這也是對阿爾泰實施獨立管理的最好辦法，即科阿分治，責權明確。
同年12月，錫恆上奏《遵擬科阿劃疆分治以專責成而資遵守折》：將科布多所屬西阿勒台山之烏梁海左翼散秩大臣一旗，總管二旗，新土爾扈特郡王一旗，貝子一旗，和碩特扎薩克臺吉一旗，共三部落十旗就近劃歸錫恆管理，以資安插哈眾，其昌吉斯臺西八卡倫並布倫托海屯田，均在烏梁海遊牧，自應一併歸阿管理，未便仍由科布多參贊遙領，至有鞭長莫及之勢。
1907年3月20日，慈禧太后在理藩院轉呈的奏摺上批了“依議”。
至此科阿正式劃界而治，科布多辦事大臣的行營設在同治年建立的承化寺。
科阿分治最終解決了“防俄”“排哈”的矛盾，最終給了長期流徙的哈薩克一塊最終的歸屬地，也使得阿爾泰成了防俄的前沿陣地。
科布多陷落後，叛軍乘勝攻打阿勒泰，欲進一步侵吞新疆地區。
