來源:央廣網
AI憑藉其強大的發現能力、學習計算能力能有效縮短新藥研發週期、降低藥物開發成本,在近年來逐漸成為生命科學領域的新風口。面對AI新藥研發這一百億級熱門賽道,國內各地都在積極推動當地生物醫藥產業與AI技術融合的創新發展。
2021年,醫圖生科(蘇州)生命科學技術有限公司(簡稱醫圖生科)在蘇州正式註冊成立。作為一家專業從事AI新藥研發的企業,該公司致力於使用世界領先的人工智慧技術推動新藥研發,造福人類健康。
醫圖生科不僅基於醫療大資料探勘進行生物醫藥研發探索,同時依託尖端人工智慧技術,並結合工程化學、計算化學、計算生物學和雲計算等技術,服務於藥物研發的各個流程。據瞭解,醫圖生科正在構建醫圖AceMap智慧藥物(小分子)研發平臺、AceMap智慧藥物(大分子)研發平臺和神農智慧中藥研發平臺。
近日,筆者與醫圖生科CEO李翛然進行了溝通。
“中國的生物醫藥產業發展熱度近年急劇上升,不僅全球和本土的生物醫藥企業紛紛積極部署,跨行業的參與者也如雨後春筍般不斷地加入到中國的生物醫藥產業中。
醫圖生科已經有多條產品線的佈局。我們的AI新藥研發平臺不僅包含由分子藥物性質預測工具、高通量虛擬分子篩選工具、成藥性/可靶性評估工具等組成的AceMap智慧藥物(小分子)研發平臺;還有包含蛋白質結構最佳化/設計、大分子合成結構與特性推斷、多肽及蛋白質重組表達模組等組成的AceMap智慧藥物(大分子)研發平臺。這些不同的工具模型能為生物醫藥企業提供有針對性的標準化服務。除此之外,我們正在打造的神農智慧中藥研發平臺,將透過中藥量化資料庫及工具集在發掘傳統醫學的潛在價值,使老藥新用,及中藥核心成分提純的工作極大的減少研發成本,不斷完善中藥有效成分的提取和分析方面發揮積極作用。未來三年,公司將以“AI新藥發現+CRO”的ITBT為核心商業模式,打造全球領先的AI創新藥研發公司。”醫圖生科CEO李翛然向記者介紹了目前公司的產品線與戰略規劃。
溝通中,李翛然還表示,醫圖生科目前正在為一家知名生物製藥公司透過蛋白質結構最佳化/設計工具集提供藥物結構最佳化設計的服務,並已獲得技術突破。
“針對企業提出的蛋白質最佳化設計需求,我們幫助該企業在突破世界級藥物大廠的專利限制同時進行了結構最佳化,既增強了其功能表現,同時繞開了專利限制。在最佳化設計過程中,我們大量的使用了創新的數學和AI工具,將其業務委託抽象為數學問題和相關約束條件。在利用創新的軟體演算法和超算中心的硬體情況下,透過引入合理的數學工具組合,AI工具預測蛋白質結構、配體與靶點的親和性預測,篩選出一批備選結構,再結合分子動力模擬最終篩選出勢能最優、動態結構最優,生物特性最優的備選方案,使得整個流程的計算量處於可控水平,並對其在人體內部的效果進行充分的模擬和評估,最終將備選的最佳結構交付給客戶。該委託獲得了客戶的充分肯定,透過實驗驗證後,極大地減少了其盲目的實驗成本,使其在接下來的新藥佈局中更加有效率的做到Best in class(BIC)。該工具標誌著醫圖生科的大分子藥物平臺正式形成產品化服務的能力。
大分子藥物設計一直是製藥領域的重大難題之一。由於其的結構更加複雜,蛋白質作用時更加多變的影響因素,重組表達的實驗設計難題,高昂的實驗成本等,一直是制約大批次大分子蛋白結構設計和藥物發現的重要因素。醫圖生科在充分實踐中將新型的數學工具融合進傳統的生物資訊學,分子動力學,藥物化學等學科,得到了首創的創新型快速、高效的新蛋白質設計工具集和設計流程。該工具可以充分滿足客戶的定製化大分子結構及功能設計,例如對專利進行佈局和反向佈局,定製特定功能的多肽或蛋白質藥物等生物製藥需求。這將對大分子藥物發現和功能蛋白設計產生重大影響,革命性地改變醫療健康行業格局。”
醫圖生科CEO李翛然認為:預測藥物特性對加速藥物發現有著重要的推動作用,基於圖神經網路等方法的人工智慧藥物篩選技術已經取得了不錯的成績。儘管如此,人類掌握的藥物和分子知識還沒有完全轉化為有效的人工智慧技術,其技術路線還有較大的提升空間。我們最近的創新方法開始改變這個局面,透過將更高維度的資訊進行重構和降維,最終讓AI可以像人臉識別那樣,利用其強大的學習和識別能力,完成藥物特徵,化學特徵,分子構象,結構推斷等特徵預測。醫圖生科基於這個新方法發展了一系列的人工智慧藥物研發工具及相關大資料庫。
醫圖生科首席科學家、清華大學深圳研究生院教授,腫瘤化學基因組學國家重點實驗室副主任陳宇綜帶領團隊引入創新方法,透過對數億化學分子的學習,將無序的化學分子特性對映到反映內在關係的有序影象中,利用其獨創的MolMapNet演算法打開了圖特徵支援藥物研發的大門。基於這個創新方法,開發了全球首創的“開箱即用”的人工智慧工具,它省去了耗時耗力的調參過程,這意味著即使是非專業使用者也可以使用該模型深度學習預測藥物特性。在接下來的研究中,我們將進一步開發這一模型,使模型可以在醫圖生科開展的醫學研究與服務中幫助更多生物製藥企業和科學家更快、更有效地預測不同藥物的特性,從而大大加快藥物研究的速度。
“醫圖生科不僅僅在技術上是全球領先的 AI 驅動藥物研發企業,同時,也創造了獨特的、充滿潛力和希望的商業模式。即透過AI新藥研發平臺提供人工智慧驅動的藥物發現服務和軟體,以及自主開發臨床前和臨床專案。公司專注把前沿AI技術與新藥研發相結合,彙集了國內外頂尖大學、研究機構的科學研究型人才以及在國內外知名藥企擁有多年從業經驗的專業團隊,兼具嚴謹科學方法論及以AI造福人類的願景,是把AI用於解決生物製藥領域重大挑戰的具體實踐。”深度孵化並投資該專案的知名投資與併購專家於小鐳博士對醫圖生科的未來發展充滿了信心。
AI新藥研發是個長跑,但是一旦成功,對人類社會的價值貢獻是巨大的。道阻且長,在這個艱難的過程中,需要更多創業企業有長期的願景和清晰的商業模式。相信未來10年至20年後,人類可以利用AI等新興技術探索出系統性發現新藥的最優路徑,大大蓬勃生物醫藥產業,為人類的疾病康復和壽命延長提供最堅實的支援。