克林黴素是作用於細菌的核糖體，抑制細菌蛋白質合成的抗菌藥物，屬於抑菌劑，與青黴素，頭孢菌素等殺菌劑比較，抗菌作用相對較弱，克林黴素的抗菌譜主要針對的是溶血性鏈球菌等革蘭陽性菌和厭氧菌，尤其對厭氧菌有較好的抗菌活性，因此在治療合併厭氧菌感染時，有獨特的價值。
呼吸道感染
在治療急性咽炎，扁桃體炎等上呼吸道感染以及肺炎等下呼吸道感染的經驗治療中，首選的藥物基本以頭孢菌素，青黴素等殺菌劑為主，克林黴素無太多優勢，對於支氣管擴張合併感染的患者，可能存在厭氧菌感染，這種情況下可以選擇克林黴素抗厭氧菌治療
泌尿道感染
泌尿道感染分外腎盂腎炎等上尿路感染和膀胱炎，尿道炎等下尿路感染，泌尿系感染的致病菌主要以大腸埃希菌等革蘭陰性菌為主，鮮有陽性菌和厭氧菌存在，因此克林黴素不適合泌尿系感染的治療。
消化道感染
常見的消化道感染主要包括急慢性胃炎，感染性腹瀉等，致病菌以沙門菌屬和志賀菌屬，以及產腸毒素的大腸埃希菌，克林黴素不僅不適合治療這類感染，而且還會導致腸道菌群失調。
面板軟組織感染
面板軟組織感染的致病菌以金黃色葡萄球菌和鏈球菌等陽性菌為主，克林黴素對於溶血性鏈球菌導致的面板軟組織感染如淋巴管炎（丹毒)，急性蜂窩組織炎等有一定的抗菌活性，若患者對青黴素，頭孢菌素過敏，可以選擇克林黴素作為替代藥物。在面板軟組織感染方面，克林黴素的優勢在於預防手術病人手術切口感染方面，當患者對頭孢類藥物過敏時，可以選擇克林黴素預防手術切口感染。
口腔頜面部感染
口腔頜面部感染，尤其是牙科感染，如牙周炎，冠周炎，牙周膿腫等，致病菌以口腔厭氧菌多見，可以選擇克林黴素作為經驗治療。
婦科感染性疾病
陰道炎，尤其是細菌性陰道病，是婦科常見的生殖道感染，細菌性陰道病最常見的病原體為陰道加德納菌、各種厭氧菌和動彎曲桿菌屬，經驗治療可以選擇甲硝唑或克林黴素作為首選的抗菌藥物品種，與同樣抗厭氧菌的甲硝唑比較，克林黴素對滴蟲沒有抗菌作用，因此如果是滴蟲陰道炎，應該選擇甲硝唑。
骨關節感染
骨關節感染主要包括骨髓炎和細菌感染導致的關節炎，致病菌以金黃色葡萄球菌和鏈球菌等陽性菌以及腸桿菌科細菌多見，也存在厭氧菌感染，由於克林黴素在骨組織中濃度高，因此對鏈球菌以及厭氧菌導致的骨關節感染有一定的治療效果，是可以選擇的抗菌藥物品種之一。
怎麼吃效果好
克林黴素屬於時間依賴性抗菌藥物，抗菌活性與藥物與細菌接觸的時間有關，接觸時間越長抗菌效果越好，因此克林黴素應該將一天的總劑量分3-4次給與，
克林黴素應避免與阿奇黴素、克拉黴素、紅黴素等大環內酯類抗菌藥物合用，這是因為克林黴素與大環內酯類藥物都作用於細菌核糖體的不同點位，作用靶點類似，合用不能起到協同作用，還會因為競爭作用靶點而削弱各自的抗菌活性。
