全真教在雙鵰時代，被稱為武學聖地玄門正宗。
只是為何到了倚天時代，全真教反而沒有訊息了呢？
最初王重陽抗金失敗，躲在活死人墓不出來。
林朝英看不過去，用激將法在外面罵了七天七夜，王重陽才肯走出古墓。
後來王重陽和林朝英打賭失敗
讓出活死人墓，出家做了道士。
在活死人墓附近，蓋了一座重陽宮，就這樣建立了全真教。
先後收了馬鈺、譚處端、劉處玄、丘處機、王處一、郝大通、孫不二為徒。
這七名弟子合稱“全真七子”。
之後《九陰真經》橫空出世，江湖中人為了秘笈大打出手，死傷無數。
為了平息這場武林浩劫，王重陽提議華山論劍決定經書歸屬權。
東邪西毒、南帝北丐受邀參加。
五人在華山絕頂比了七天七夜，最終王重陽力壓四絕獲得九陰真經。
又奪得天下第一的稱號。
之後全真教更是名聲大振，只是王重陽自己沒有練九陰真經。，也沒有讓弟子們練習。
全真教側重於道家思想的傳播，對於武功方面看的很淡。
全真七子中丘處機武功最高，反而最不得王重陽喜歡。
王重陽說他一心練武，荒廢了道家功夫。
王重陽病逝後，掌教真人變成了馬鈺。
只是九陰真經這樣的高階武功，全真七子沒有練成。
王重陽的絕技先天功也沒有傳下來。
為了對付歐陽鋒，只給弟子們留下了一套天罡北斗陣。
王重陽雖然不在了，但是餘威還在。
師叔周伯通也是武功高強，全真七子也經常在江湖上走動。
只是在和黃藥師交手的時候，歐陽鋒下場偷襲，一掌打死譚處端。
自此全真七子成了六子。
只是這些弟子沒有一人，能達到王重陽的高度。
射鵰最後，丘處機帶領門下十八名弟子。
西行萬里遠赴大漠，覲見成吉思汗，為其講解長生之術。
一言止殺，救萬民於水火，可以說是功德無量。
到了神鵰時期，全真教的勢力越來越大。
全真六子也收了不少門人弟子，在武林中名氣越來越響。
平素行俠仗義，扶危解困做下了無數好事。
江湖上不論是否武學之士，凡聽到全真教的名頭，都十分尊重。
郭靖送楊過上全真教習武，也是想著全真教是武學正宗。
全真教第三代弟子中的領軍人物是：
王處一門下弟子趙志敬和丘處機門下弟子尹志平。
趙志敬心胸狹窄，因為敗給郭靖，一直懷恨在心。
郭靖走後，處處針對楊過，致使楊過轉投古墓派。
後來為了爭奪掌教之位，更是和蒙古人勾結，陷害同門。
尹志平也是德行有虧，趁機玷汙小龍女，後來一再被趙志敬要挾。
可以說在第三代弟子之間，發生了嚴重的內鬥，這就降低了全真教的實力。
弟子們都想得到掌門之位，自然做不到齊心協力。
周伯通雖然收了個好徒弟耶律齊，但是耶律齊做了丐幫幫主，也跟全真教沒啥關係。
從這裡就可以看出來，全真教已經人才凋零，武功方面更是一代不如一代。
之後全真教拒絕接受蒙古冊封，蒙古人惱羞成怒，一把火燒了重陽宮。
而丘處機等人早就有所安排，才沒有造成大的損失。
之後掌教位子，由丘處機門下弟子宋道安擔任。
全真教雖然武功沒落，但是在對抗蒙古方面一直走在最前線。
郭靖守衛襄陽的時候，丐幫傾盡全力幫忙，全真教也是不遺餘力。
大勝關英雄大會的時候，郝大通、孫不二到場、
之後對抗蒙哥的時候，新掌教宋道安率領全真教三十六名師兄弟到場。
黃藥師佈置戰場的時候，西路軍以全真教為主力。
主將是周伯通，其他七隊都是由宋道安率領的全真教第三代弟子統領。
用天罡北斗陣和蒙古決一死戰。
之後襄陽陷落，郭靖黃蓉夫婦戰死襄陽。
丐幫也開始走向衰落，雖然沒有提及全真教，相信全真教也沒有置身事外。
本就人才凋零，再又經過這樣的大戰，全真教在倚天中衰落也就不奇怪了。
而在倚天屠龍記中，少林、峨眉、武當迅速崛起，成了武林中的領軍人物。
反而之前人氣鼎盛的全真教沒有蹤影，全真教去哪裡了呢？
金庸先生在200年的《倚天屠龍記》世紀新修版中，交代了全真教的下落。
趙敏冒充張無忌上武當山，目的是為了招降張三丰。
趙敏說道：普天之下，莫非王土。率土之濱，莫非王臣。
我蒙古皇帝威加四海，張真人若能效順。
皇上立頒殊封，武當派自當大蒙榮寵。
就如當年我太祖皇帝，榮封全真教長春真人一般，敕管天下道教。
這裡提到了成吉思汗冊封長春真人丘處機的事。
而在三聯版中，卻沒有提起。
相信金庸先生不會無緣無故加這句話。
在倚天屠龍記中，故事的整體走向是抗擊元朝統治。
峨眉、武當、少林、明教都是以驅逐蒙元為己任。
如果按新修版所說，全真教在成吉思汗統治時期，就已經投靠了蒙古。
那麼全真教已經站在了大家的對立面，如果全真教再出現 反而跟歷史不符。
