普拉提亞戰役和米卡列海角之戰結束後，薛西斯一蹶不振，開始沉迷於享樂，終日行荒淫和亂倫之事，至此波斯帝國宮廷鬥爭不斷，公元前465年薛西斯一世終於在殘暴荒淫的統治了20年後被暗殺，而雅典則在他統治的這段時間逐漸崛起成為強大的海洋帝國，埃及也慢慢恢復了實力，終於在公元前 460 年薛西斯一世去世後，埃及迎來了復國的曙光，轟轟烈烈地再次爆發起義。波斯帝國自身則在連年征戰、無能統治以及宦官及后妃干政下逐漸迎來了王朝的衰亡。
- 將近50年希波戰爭的終結
公元前478年冬季，在結束了對黑海地區的征服後普拉提亞戰役和米卡列海角之戰，波斯一敗到底，雅典海上帝國崛起，雅典集結了愛琴海諸島、小亞各城邦、色雷斯沿岸城邦，在提洛島組織成立了提洛同盟，同盟成立後繼續向被波斯佔領的地區進攻。公元前476年波斯被趕回亞細亞，到公元前466年，雅典徹底取得了對愛琴海、黑海和小亞沿岸地區的控制權。與此同時同盟內部的關係也開始變得日益不平等起來，雅典掌握了實際指揮權，其他盟邦成為附屬國，不僅需要向雅典納貢，不聽話的還會被收拾，不過這也阻止不了盟邦數量的增加，到公元前466年時邦國數量已經增加到250個。
雅典佔據的勢力範圍
公元前460年，埃及爆發了反對波斯統治的起義，雅典率領海軍同盟前往支援，但不幸的是瘦死的駱駝比馬大，憑藉地理條件的優勢，同盟的200只戰船和40000名將士全部覆滅，提洛島也受到了波斯的包圍，雅典人趁此機會將同盟的金庫全部轉移到雅典衛城，至此同盟的財政收入、內政和司法全部被雅典掌控。
公元前449年，波斯由皇帝阿爾塔薛西斯一世統治時期，趁著波斯內亂，雅典海軍率領同盟軍在塞普勒斯島附近的薩拉米大勝波斯海軍。波斯這回徹底認識到再也無法從希臘手中奪得任何土和水，戰爭繼續打下去只會加劇內亂，阿爾塔薛西斯只能命令前線將領派人到希臘求和。而此時，雅典那邊的形式其實也不好，他們開始面臨著盟邦的背叛，以及斯巴達帶領的伯羅奔尼撒同盟的挑釁。於是戰爭還處於有利的局面選擇握手言和，雙方在蘇薩簽訂了《卡里亞斯和約》。
和約規定，波斯放棄對愛琴海的霸權，允許小亞希臘城邦獨立，也就是承認了雅典的勢力範圍。作為回報，雅典答應不干預波斯對其屬地的統治，放棄對埃及的干涉。至此，兩大宿敵握手言和，持續了近 50 年的希波戰爭最終結束。
- 波斯逐漸衰亡中的埃及反覆復國之路和希臘崛起之路
第三次埃及起義
自公元前525年埃及第26王朝被波斯皇帝岡比西斯二世滅亡後，在大流士一世統治時期，埃及先後經歷了公元前521年的第一次起義和公元前486年的第二次起義。公元前460年，趁著希波戰爭中波斯的逐漸失勢，以及波斯因宮廷內鬥削弱了自己的威望和力量，埃及爆發了第三次起義，這場起義由埃及第 26 王朝末代法老普薩美提克三世的兒子伊納羅司發動。
回到大流士一世統治時期，他雖然在公元前518年率軍鎮壓了第一次起義，但卻在還未來得及鎮壓第二次下就溘然長逝。公元前484年，薛西斯一世繼承皇位穩定國內統治後派兵鎮壓起義，任命阿凱美涅斯為埃及總督，但埃及世襲王公的權利並沒有被剝奪，所以很快伊納羅司就控制了利比亞行省，抓緊發展自己的勢力，等待時機發起起義。在聽說敘司塔司佩斯於巴克特里亞組織發動起義後，伊納羅司趕緊抓住時機組織發起起義，他一面招募僱傭兵以及請求雅典給予支援，一面呼籲民眾的參與，很快埃及各地所有的民眾便加入到起義隊伍中。但此時他們還要面臨尼羅河谷地各軍事要地駐紮的波斯軍。
埃及第三次起義
幸好在這時已經逐漸強大起來掌控東地中海霸權的雅典響應了埃及的求助，雅典及其同盟邦國共派出200只三段橈船，以及40000名將士，但實際上雅典的目的是不想再冒險透過黑海到南俄購買糧食，想要從埃及獲得充足的糧食。
公元前460年，埃及與雅典聯軍最終和波斯軍隊在尼羅河三角洲的帕普雷米斯相遇，經過激烈的戰鬥後，波斯主帥主帥阿凱美涅斯陣亡，腓尼基的50只戰船被擊沉，活下來的船員被俘虜。雅典人想著乘勝佔領孟菲斯，但卻遭到了波斯守軍的頑強抵抗。公元前456年波斯派出更龐大軍隊鎮壓起義，這次軍隊的規模有30萬，配備了300只腓尼基戰船，阿爾塔薛西斯一世派遣了更有軍事能力的美伽巴佐斯作為統帥。這支大軍與原來孟菲斯的守軍一起擊敗了附近的埃及與雅典聯軍。
埃及起義軍與波斯大軍對抗
埃及起義軍這邊被擊潰後，首領伊納羅司被俘虜，雅典剩餘的兵力則逃到了普洛索披斯附近的一個小島上，一年半後，波斯大軍挖通尼羅河的一條支流，小島周圍成為陸地，雅典聯軍的船變成旱船，他們只能在焚燒了所有船後與波斯軍隊進行殊死一搏，絕大多數人都戰死，剩下的6000人只能放棄抵抗選擇投降。波斯統帥美伽巴佐斯信守了他的承諾，將投降的人都押送回了蘇薩，並積極向皇帝求情饒恕了他們。美伽巴佐斯再次率軍回到埃及後，輕易就率腓尼基戰船和陸軍擊敗了前來支援的50只雅典戰船。埃及這邊僥倖活下來的人擁戴阿瑪西斯宗族的一個後裔為王，在尼羅河三角洲中的一個小島上駐紮，開啟了游擊戰，波斯這邊也便沒有管這股不成氣候的勢力。
美伽巴佐斯叛亂帝國衰亡的前兆
平定埃及叛亂的美伽巴佐斯出身顯赫，他本人是薛西斯一世的女婿，他的祖父是與大流士一世一起發動政變的七大貴族之一，他的父親則是最受大流士一世寵信的功臣，其平定了巴比倫的叛亂，在阿爾塔巴諾斯謀殺了薛西斯一世後，又想殺害阿爾塔薛西斯時，他率軍英勇的擊殺了全部叛軍。
接替阿凱美涅斯平定埃及叛亂後，美伽巴佐斯一直積極地勸說阿爾塔薛西斯一世饒恕了埃及叛亂首領伊納羅司和投降的6000 名雅典聯軍士兵，但奈何不住皇太后阿美司妥利斯的干政，他堅持要給死去的王叔阿凱美涅斯報仇，要將這些叛徒全部處死。雖然阿凱美涅斯向阿爾塔薛西斯一世詳細地陳述了他們投降的過程，但作為皇帝的阿爾塔薛西斯一世因為軟弱卻不敢做主，經過5年皇太后的不斷勸說，終於這些降軍全部被處死。這件事讓美伽巴佐斯深受打擊，因為他沒有信守住承諾，使得他的名譽在國內外嚴重受損，終於受打擊感到恥辱的他在被皇太后激怒後，於公元前450年發動了叛亂。
持續多年的這場叛亂雖然最終以失敗告終，但卻是帝國衰亡的前兆，宦官和後宮勢力開始分配政治權利，帝國的興衰與對外交往關係越來越密切，波斯民族傳統的優良傳統受到巨大沖擊，這些都加速了皇帝威嚴和統治權利的削減，號召力逐漸喪失。
雅典為首的提洛同盟和以斯巴達為首的伯羅奔尼撒同盟，與波斯分別建立外交合作關係，希臘對埃及的影響增加，使得波斯的內部國運開始與外部交往密切關聯起來；薛西斯一世去世後，諸皇子為爭奪皇位發動的宮廷政變及引發的地方叛亂、隨意殺害招降的俘虜、皇帝與臣子的關係出現嫌隙，使得波斯傳統的集體觀念、老實不說謊、主僕忠誠情誼等優良傳統受到衝擊，皇帝的威權和號召力逐漸喪失；不過因薛西斯一世荒淫和亂倫引起的宦官和後宮勢力崛起，開始分配皇帝的政治權利，才是一切衰亡的源頭。
薛西斯時期波斯的宮廷內鬥
一切要從薛西斯一世看上自己弟弟瑪西司鐵斯的妻子開始說起。在威逼利誘自己的弟媳不成，又礙於弟弟的面子，薛西斯一世決定讓自己的兒子大流士娶弟弟的女兒阿爾塔翁鐵為妻，以為這樣就可以得到弟媳，不過在後來看上兒媳後就將她的母親忘記了，薛西斯一世誘姦霸佔了自己的兒媳。但這件事很快就敗露，被皇后阿美司妥利斯發現，她並沒有懲罰這個女孩，而是用酷刑殘忍的懲罰了她的母親。瑪西司鐵斯看到妻子的慘狀，憤怒之下召集兒子們和下屬商議回屬地巴克特里亞發動叛亂，不過訊息很快傳到了薛西斯一世的耳中，他下令將弟弟的全家、侍從和衛隊全部殺死。
公元前465年，薛西斯一世被他親信的宦官阿帕米特拉斯和宮廷衛隊長阿爾塔巴諾斯合謀殺死，在他死後，阿爾塔巴諾斯將刺殺的罪名安在其子大流士身上，因為他和他的妻子阿爾塔翁鐵有充足的謀殺理由，接下來又哄騙18歲的皇子阿爾塔薛西斯以弒父之罪殺害了大流士。在阿爾塔巴諾斯還想繼續殺害阿爾塔薛西斯時，被薛西斯一世的女婿美伽巴佐斯殺死。阿爾塔薛西斯雖然繼承皇位，但也打破了長子繼承製的傳統，導致他的另一個哥哥敘司塔司佩斯也在巴克特里亞發動了叛亂，隨即受此影響埃及爆發了第三次起義。這幾次叛亂雖然被鎮壓，但內鬥使得波斯帝國的統治變得非常不穩定，皇權變得越來越脆弱。
宮廷內鬥加劇與叛亂不斷
實際上阿爾塔薛西斯一世是一個非常懦弱且無大志的皇帝，每次鎮壓叛亂後做得都不徹底，沒有真正如居魯士大帝和大流士一世一樣徹底解決矛盾問題。他的性格自然受到強勢的母親，即皇太后阿美司妥利斯的影響。在皇太后去世、阿爾塔薛西斯以及他的皇后達瑪斯皮亞相繼去世後，波斯宮廷又開始了皇位爭奪戰。
薛西斯二世在繼位45天后被其弟塞古迪安殺死，塞古迪安繼任皇位後開始地方自己的兄弟歐克胡斯，歐克胡斯是阿爾塔薛西斯一世的另一個兒子，他在娶了同父異母的妹妹帕爾塞提斯後，又被任命為敘爾卡尼亞的總督，明面上去蘇薩朝貢，暗地裡卻召集軍隊自立為王，很快他就獲得了埃及總督阿爾撒美斯、騎兵司令阿爾巴督斯和宦官頭目阿爾託撒列斯的支援。公元前423年2月，他在巴比倫自稱為萬王之王，號稱大流士二世，隨後前往蘇薩用計燒死了並不受支援的塞古迪安，同年在埃及的厄勒潘汀及三角洲地區都陸續發動了小規模叛亂。
在大流士二世繼位期間，他的另一個兄弟阿西德在美伽巴佐斯的兒子阿爾杜庇歐斯支援下也發動了奪位的叛亂。阿西德雖然憑藉金錢拉攏希臘僱傭軍獲得了兩次勝利，但大流士二世則運用金錢同樣收買了更多的希臘僱傭軍，並讓他們不再支援阿西德，最終阿西德的叛亂以失敗告終，他與塞古迪安一樣被丟進火堆處死。在公元前412年，起義的呂底亞總督皮蘇提涅斯也經歷了同樣的結果。大流士二世統治的20年間還支援斯巴達贏得伯羅奔尼撒戰爭的勝利，不過這也使得在他去世後斯巴達開始干預波斯的繼承戰。
大流士二世統治期間宦官的勢力繼續增加，他的妹妹即皇后帕爾塞提斯的影響力也開始加大，在接連不斷的宮廷政變和各地方叛亂影響下，帝國基本已經處於解體狀態。其中影響最大的就是大流士二世的女婿鐵裡圖奇麥斯的叛亂，他因為愛上了自己同父異母的妹妹羅克薩娜，打算將公主裝進袋子刺死，不成想卻被發現，皇后帕爾塞提斯將參與謀反的人全部處死，羅克薩娜被分屍，他的其他兄弟姐妹和母親都被處死，只有駐守撒爾迪斯有功的哥哥和作為皇子妃的姐姐倖存了下來。支援大流士二世上位的宦官阿爾託撒列斯也在米底發動叛亂想要奪得皇位，但最終被他所謂的妻子出賣。除此之外，在公元前426年-前411年，埃及和塞普勒斯也相繼發生了叛亂。
與希臘之間的博弈
伯倫奔尼撒戰爭進行時波斯本想著坐山觀虎鬥從中獲利，不成想公元前413年撒爾迪斯卻發生了叛亂，幸虧後來被提薩非爾涅斯（前面大流士二世女婿鐵裡圖奇麥斯的哥哥）鎮壓下去，他成為新的總督，原來的總督皮蘇特涅斯勾結雅典引發小亞叛亂被處死，在他的智慧下希臘各股勢力被瓦解。隨後在提薩非爾涅斯主持下，波斯與斯巴達簽訂了同盟和約，波斯出金錢支援斯巴達消滅雅典，公元前404年，持續了27年的伯倫奔尼撒戰爭結束，斯巴達擊敗雅典重新奪得希臘的霸權。
大流士二世之墓
公元前404年，大流士二世去世，他的兩個兒子阿爾塔薛西斯二世和居魯士三世（小居魯士）為奪得統治權爆發了內戰，因為之前小居魯士一改提薩非爾涅斯的外交策略，一心只支援斯巴達，使得斯巴達以支援居魯士三世為名，參與到波斯內政中，奪位戰使得越來越多的希臘僱傭軍進入帝國，小亞的統治嚴重動搖，為之後的外敵入侵埋下了非常大的隱患。
公元前401年，隨著阿爾塔薛西斯二世擊敗居魯士三世，在奪位失敗後斯巴達也與波斯的同盟關係破裂。公元前400年，波斯帝國和斯巴達爆發戰爭，波斯又以金錢收買雅典、科林斯、阿爾哥斯和底比斯，一起聯合攻打斯巴達，不過在這一過程中，於公元前394年雅典的海上霸權得以恢復，最終在內外夾攻下，斯巴達只能與波斯在公元前387年再次締結了和約，波斯則又恢復了對小亞沿岸的統治權。
埃及的復國及再次滅亡
公元前404年，趁著大流士二世去世，以及波斯忙於內戰，阿米爾塔尼烏斯發動起義，建立了埃及第28王朝，到公元前400年，波斯勢力被徹底逐出埃及，不過在公元前399年阿米爾塔尼烏斯就被殺害，內法阿魯德定都門德斯，史稱內法阿魯德一世，建立埃及第29王朝，定都塞易斯。公元前385年，阿爾塔薛西斯二世率兵入侵埃及，公元前382年法老哈考爾擊退波斯，公元前373年，第30王朝法老內克塔內布一世依託於尼洛河水氾濫擊敗了阿爾塔薛西斯二世的再次入侵。在這期間埃及還給爆發叛亂的塞普勒斯送去了大量糧食和金錢，雅典也積極支援埃及抵抗波斯。
埃及入侵波斯
復國後再加上有希臘人支援的埃及開始忘乎所以（實際上希臘人已經與波斯和解了），法老泰奧斯竟然在公元前360年開始反向入侵波斯，不幸的是，這時埃及國內發生了政變，他的侄子被立為法老內克塔內布二世，隨後他的軍隊也背叛了他，無奈之下泰奧斯只好投奔波斯。公元前348年，塞普勒斯和腓尼基城邦反抗波斯的統治，法老內克塔內布二世給予軍事援助，公元前343年阿爾塔薛西斯三世鎮壓完塞普勒斯和腓尼基城邦的起義後，立即揮師向埃及進攻，公元前342年古埃及第30王朝滅亡，法老內克塔內布二世後逃往庫施避難。
埃及再次滅亡
公元前338年，阿爾塔薛西斯三世和他的兒子都被宦官巴戈阿斯殺害，他擁立了僅存的少子阿爾塞斯繼位，埃及趁機爆發反抗波斯統治的起義；公元前336年，巴戈阿斯殺害阿爾塞斯，擁立大流士三世為王，但沒想到他上位後立即迫使巴戈阿斯飲酒自盡將其剷除。
公元前335年大流士三世鎮壓了埃及的起義。大流士三世雖然並不算昏庸無能，但生不逢時，好景不長，強大的敵人已經靠近，公元前334年馬其頓國王亞歷山大率軍隊渡過達達尼爾海峽，在格拉尼庫斯戰役擊敗了波斯軍隊，公元前333年在伊蘇斯戰役中擊敗大流士三世。公元前332年，亞歷山大攻陷推羅後，繼續南下進攻埃及，埃及的波斯駐軍立即投降，亞歷山大在孟菲斯接受“埃及法老”的稱號。公元前330年亞歷山大征服波斯帝國。至此埃及和波斯統治的地區進入“希臘化”階段。
馬其頓亞歷山大帝國
波斯的逐漸衰亡
阿爾塔薛西斯二世在擊敗居魯士三世（小居魯士）繼位後，共統治了46年，在他遠征埃及失敗後，雖然與希臘和解了，但波斯帝國此時已經非常衰弱，根本無力鎮壓各地的叛亂，希臘人在這時則充當了他們之間的仲裁者，在阿爾塔薛西斯二世統治晚年，各個行省一個接一個叛亂，帝國似乎馬上就要土崩瓦解，但各行省之間的內鬥和賄賂行為則使帝國得以繼續維持。
阿爾塔薛西斯二世之墓
阿爾塔薛西斯二世最終以高齡病逝，他始終處於母后帕爾塞提斯的影響下，她還毒死了他心愛的皇后，並逼迫他娶自己的女兒阿託撒，由此也引發了日後的不幸，他一共生育了一百多個兒子，但基本都在他之前去世。希臘妃子生的長子大流士被任命為皇儲，但深受皇太后鍾愛的皇子奧卡胡斯（也是這位希臘妃子所生）卻想取而代之。奧卡胡斯慫恿哥哥大流士使父皇遇刺，以便早些繼位，沒想到大流士真的輕信了他的蠱惑，結果被發現後處死，他還恐嚇另一位兄長阿里阿斯皮斯，說已經掌握他謀反的訊息，結果逼得他服毒自盡。奧卡胡斯的這一系列行為得到了現任皇后阿託撒的幫助，條件是繼位後繼續娶她為妻。
阿爾塔薛西斯三世之墓
奧卡胡斯上位後號稱阿爾塔薛西斯三世，為防止叛亂，他殺光了自己所有的兄弟姐妹，為阻止波斯帝國土崩瓦解，他重新組建了一支更強大的軍隊。在他統治期間小亞行省、弗裡吉亞行省得到了雅典人和底比斯人的反抗支援，敘利亞、塞普勒斯、腓尼基得到了埃及的支援。他親率大軍在西頓進行了一場大屠殺，使堅固的西頓成為一片廢墟，其他城市因恐懼紛紛投降；奧卡胡斯對埃及採取了殘暴的報復行動，不但殺死了阿庇斯神牛，而且還在慶賀佔領孟斐斯的宴會上大享其美味，他摧毀城市，拆掉神廟，殺死了成千上萬的埃及人。
收服埃及後，西部的各行省開始安分起來，但裡海地區已經基本獨立，印度那邊的行省也背叛了波斯的宗主權，在宦官巴戈亞斯的幫忙管理下，國家的管理雖然恢復，崛起的馬其頓受到一定壓制，但更大的隱患也隨之而來。公元前 338 年，巴戈亞斯為避免自己被處死，先下手為強刺殺了皇帝，並扶持最小的皇子即位；然後，他矯詔殺死了阿塔薛西斯三世絕大多數的兒子，當幼小的皇帝表現出獨立傾向時，這位殘忍的宦官就把他也殺了。
戰場上的大流士三世
當皇室已經沒有正統繼承人後，他找來了一個叫科多曼紐斯的王室旁支後裔為王，號稱大流士三世。而大流士三世在處決掉巴戈亞斯後也迎來了波斯帝國強大的剋星，即崛起的馬其頓王國，至此，經過幾場戰役後波斯第一帝國宣告滅亡。自公元前 550 年居魯士滅米底王國建立阿契美尼德王朝，至公元前330年大流士三世敗亡、王都失陷，波斯帝國曆時兩百餘年，前後歷經11位王。回顧波斯帝國的興亡史，不禁令人深深的反思和感慨。
