這一集講述的是一名叫做小川的醫生，從兩年前開始每個月都有固定收到一百萬日元的現金以及小孩子的玩具，而這個月突然收到了2500萬日元的現金，讓他很是不安，希望透過毛利小五郎可以找到這個人，把這些東西還給對方。
而在破案的過程中，柯南絲毫沒有察覺到自己的各種推理習慣，表現出來對細節的關注，以及完全不同於小學生的高智商而讓小蘭產生了他就是新一的念頭。
柯南僅僅是因為看到小川先生的食指，就斷定對方是外科醫生，玩具又是舊的，沒有條形碼，推斷出是不是小川醫生的病患為了表示自己的感謝而送的禮物，從而提出到小川醫生工作的醫院調查。
毛利小五郎一行人到達小川醫生工作地米花醫院的時候，一名護士拿著一盆牽牛花給小川醫生送來，說是剛剛收到的。小川醫生說去年的2月19日也收到了這樣的一盆牽牛花，而當時的季節是不會有牽牛花的，說明這盆花是專門培育的，小蘭說牽牛花的話語是“虛幻的愛“。那麼會是有什麼人暗暗地歡上了小川醫生嗎？
幾人在小川醫生的辦公室查詢檔案的時候，小蘭又發現柯南看病歷的速度絕對不是小學生應該有的速度，而且之前每次案件發生時，似乎所有的關鍵線索的都是柯南找到並引導毛利小五郎發現的。更關鍵的是，新一消失的那一天正好是柯南出現的那一天，語氣，行動能力，推理能力都讓小蘭確認柯南就是新一。
小蘭在柯南思考的時候突然試探的叫出了新一，而柯南因為沉浸在思考中，反應慢了幾秒，好在他迅速的用玩遊戲機矇混過去，也是因為這個遊戲機，讓他發現了遊戲機中的名字是小川醫生病患中的一個名叫智野的五歲孩子，因為盲腸炎送到醫院，卻因為送來的時間太晚延誤了治療而死亡。
這時，柯南認定對方並不是要對小川醫生表示感謝，而是對小川醫生懷恨在心的要報復。柯南立刻提醒小川醫生確認自己小孩的情況時，幼兒園表示小川醫生的孩子已經被人接走了。幾人開始在周圍尋找小川醫生孩子的下落。
當幾人找到小川醫生孩子永太的時候，罪犯正要對永太下殺手，罪犯希望小川醫生也嚐嚐失去兒子的滋味。而永太聽到自己這兩年收到玩具都是這位罪犯叔叔送給自己的，立刻對這位叔叔表示感謝，並說自己有好好地對待那些玩具，正是因為孩子的單純和善良讓這位罪犯看到了自己兒子智野的影子而悔恨不已。
其實這名父親也知道自己的兒子智野並非死於醫療事故，只是失去孩子的痛苦實在讓人難以承受，才將這一切的悔恨轉換成對醫生的怨恨，因為只有這樣，才能讓自己好過一些。不過幸好沒有最終釀成更大的悲劇。而小川醫生也表示自己是一名父親，所以懂得他失去孩子的悲傷，決定不追究責任。
而柯南也因為拜託阿笠博士代替自己給小蘭打一通電話，從而洗脫柯南就是新一的嫌疑，也幸虧小蘭神經大條，就這麼相信了。
