神秘的入口，空屋裡的水源，最近被開啟的窗戶，傳說中的“鬼屋”到底隱藏著怎樣的秘密？
這天幫媽媽打醬油回來的步美看到了詭異的一團火。於是，第二天步美邀請柯南一起去探險。據說，在四丁目的老洋房裡，房主人被殺后里面就變得詭異，半夜總是發出嚇人的嘆息聲。還好光彥是個明白人，因為鬼魂什麼的只有在漫畫裡才有。但是為了證明步美沒有說謊，這晚大家帶著棒球，點心，手電筒和指南針一起來探險。在元太的帶領下，大家從草叢中找到了入口。陰森的房屋，下雨的天氣，步美嚇得想回家。
獨自去廁所的光彥進了地下室。突然，一聲驚嚇傳來，柯南利用阿笠博士發明的伸縮吊帶打開了地下室的門。原來，地下室裡有間牢房，裡面有一個長髮男人。而關著他的不是別人，而是他的媽媽。而出口、水源、開啟的視窗都是有人存在的證明。
之所以女人把兒子關在地下室，是因為兒子當年因為高考三次落榜早到父親的謾罵。失去理智的他過失殺了人。為了保護兒子，女人把他藏到了這裡，但是他一直深受良心譴責，而傳出的嚇人嘆息聲就是兒子發出的自責和後悔聲。
一夜過去，母子倆向警方自首，而夜不歸宿的四人被家人狠狠地教訓了一頓。
