目前還沒有完全治癒慢性乙型肝炎的方法。然而，一些有效的治療選擇可以降低肝損傷的風險，減緩或阻止病毒傳播。
慢性乙型肝炎感染可以用抗病毒藥物治療，例如聚乙二醇干擾素、替諾福韋、恩替卡韋和艾拉酚替諾福韋。抗病毒藥物有助於從血液中清除病毒，同時還可以降低患肝癌和肝硬化的風險。
在過去的二十年中，慢性乙型肝炎患者的治療發生了巨大的變化。目前，口服核苷酸類似物具有強大的病毒抑制作用和高耐藥性遺傳屏障，即恩替卡韋、替諾福韋酯和替諾福韋艾拉酚胺，被推薦作為一線抗病毒藥物。
長期服抗病毒藥物治療可以抑制乙型肝炎病毒複製，逆轉肝纖維化，降低肝細胞癌的風險。
在口服抗病毒治療時代，功能性治癒和有限治療是臨床醫生需要解決的少數未滿足的需求。
研究人員發現在33名HBeAg陰性、基因型D感染、未接受過抗病毒藥物的慢性乙型肝炎患者中，在停止阿德福韋單藥治療後長達6年的治療後隨訪期間，治療中止可能導致高達40%的HBsAg消失。
4-5年的成功治療。非再治療和治療結束時(EOT)較高的ALT水平與較高的HBsAg消失發生率相關。
此後，越來越多的研究表明，由於宿主免疫反應的啟用以及亞洲和白種人HBeAg陰性患者的治療後復發，停止抗病毒治療治療後HBsAg可以被清除。
在歐洲的一項隨機對照試驗(RCT)（FINITE研究）中，42名HBeAg陰性，主要是白種人患者停止或繼續抗病毒治療治療；停止治療組中19%的患者在停藥第144周時實現了HBsAg消失，而繼續治療組中沒有患者清除HBsAg。
儘管越來越多的證據表明停止治療後HBsAg消失率增加，但停止治療的有效性仍然存在爭議，主要與對停止治療危害的擔憂有關。
治療停止後有兩種型別的HBsAg清除：一種是從治療期間的完全病毒抑制平穩過渡到治療後完全病毒清除，沒有任何病毒反彈，而另一種是最初的病毒和臨床發作，然後是免疫控制。第二個比第一個更頻繁，不是醫生和患者想要遇到的。
這可以幫助清除HBsAg實現功能性治癒；然而，與臨床發作相關的壞死、炎症和肝再生是乙肝病毒相關肝細胞癌的眾所周知的危險因素。
從理論上講，臨床發作治癒的患者仍然面臨發展為肝細胞癌的風險。
還應考慮停止治療可能造成的身體、經濟和心理傷害。身體傷害可能來自密切的監測測試，並且不僅限於醫療併發症。
目前關於停止治療的研究不夠充分或不夠全面，不足以導致廣泛的正規化轉變，即建議在持續抑制病毒的HBeAg陰性乙肝患者中停止口服治療。
在具有新靶點和新機制的新型抗乙肝病毒藥物出現之前，我們的主要目標是降低主要由肝細胞癌引起的肝臟相關死亡率，這也是世界衛生組織的目標。
