伊斯蘭教原教旨主義是當今伊斯蘭世界的一個重要思潮，在許多伊斯蘭世界得到廣泛支援。許多穆斯林認為現代世界受到世俗化、西方化的影響，不合其信仰的教導，試圖回到其信仰的原初狀態，根據《可蘭經》來嚴格管理個人和社會生活。五十年代以來，由以色列問題為導火線，阿拉伯社會和西方社會產生強烈衝突，後來出現的阿拉伯恐怖分子一般都有伊斯蘭教原教旨主義的宗教背景，如蓋達、博科聖地等，因此原教旨主義在西方國家往往在無形中帶上負面的意義。其實在原教旨主義運動中對武裝運動也有溫和派，但他們在原教旨運動中常常不能取得領導地位。
伊斯蘭教中的極端主義可以溯源到第7世紀的哈瓦利吉派。他們由其政治觀點出發，發展了極端的，和主流什葉派及遜尼派不同的教義。哈瓦利吉派特別以在Takfir上採取激進的作法而著稱，他們認為其他的穆斯林都是不信者，因此都應當受死。
什葉派和遜尼派在第七世紀起而有的宗教衝突也開啟了一些激烈的意識形態，例如阿里·沙里亞蒂 （1933–77）融合了社會革命以及伊斯蘭原教旨主義，像是1979年的伊朗伊斯蘭革命，瓦哈比派的原教旨主義在全世界推廣，且受到沙烏地阿拉伯、卡達及巴基斯坦及經濟支援。
1979年至1980年的伊朗人質危機是fundamentalism（原教旨主義）此一詞語的轉捩點。媒體設法向西方的讀者解釋魯霍拉·穆薩維·霍梅尼的意識形態以及伊朗伊斯蘭革命，於是描述成“伊斯蘭教的原教旨主義”，類似在美國的基督教原教旨主義，因此產生了“伊斯蘭原教旨主義”，也成為後續常用的詞語。
