- 隨著科學技術的發展,我們認識到腫瘤病的實質就是基因發生了突變,從而導致原癌基因啟用,病變細胞失去調控,無限增殖形成了腫瘤。所以現在腫瘤手術後或者穿刺取病理後,醫生都建議做腫瘤NGS檢測,但是大家知道 NGS檢測報告的意義碼?
以下使用樣表,對 NGS 測序結果進行解釋。 (1)基本資訊
一份 NGS 報告,最前方即為基本資訊,那到手後需要核對這些資訊是否屬於患者本人本次檢驗的結果。
(2)報告小結
報告小結為整個 NGS 測序核心內容的概括性體現。其中:①有臨床意義的變異:即可以作為依據進行相應臨床診療決策的基因突變。腫瘤治療中,可以據此選擇治療方案。②胚系突變:指人在胚胎髮育時就已經存在的基因突變,通常來自父母,與疾病的遺傳風險有關。③腫瘤突變負荷(TMB):評價基因突變頻率高低。腫瘤突變負荷高,可能意味著免疫治療療效相對好。④總體質控評估:結果為合格或不合格。質控合格意味著經檢測機構的質控檢查,一份 NGS報告質量合格。
(3)I 類變異
上面提到了,具有臨床意義的變異,指的是可以作為依據進行相應臨床診療決策的基因突變。事實上,基因突變根據其臨床意義的高低,分為 4 大類;而在提這 4 大類之前,我們先要明確一個概念,即「證據等級」。
①證據等級:臨床上將根據基因檢測結果的用藥根據證據分為 4 個級別:A 級:中國國家藥監局(CFDA)或美國食品藥品監督管理局(FDA)批准的用藥或專業指南推薦的用藥;B 級:經過高質量的臨床研究證實,並且獲得該領域專家共識的用藥;C 級:中國國家藥監局(CFDA)或美國食品藥品監督管理局(FDA)在其他癌症種類上批准過的療法或在研療法;或者多項已經發表的小型研究,獲得了部分專家的共識;D 級:還未進入臨床研究,只做了進入臨床之前的研究;或者只有少量個案報道,沒有專家共識。
我們把擁有 A 級或者 B 級用藥證據的突變稱為「I 類變異」,而有 C 或 D 級用藥證據的突變稱為「II 類變異」,二者合稱「有臨床意義的變異」。而 III 類變異臨床意義不明,IV 類變異則指無害或沒有已經發表的有害證據的變異。
②丰度:即為突變丰度,可以簡單理解為突變基因在腫瘤細胞中的佔比。一個基因突變的丰度越高,腫瘤組織中含有這種突變基因的細胞比例越大。
③潛在獲益藥物:靶向藥物針對突變的基因作為靶點。因此,根據突變的基因,存在針對性的靶向藥物可供使用。患者需要結合自身情況,與醫生充分溝通,遵醫囑使用靶向藥物。
(4)胚系突變
指人在胚胎髮育時就已經存在的基因突變,通常來自父母,分為「致病、可能致病、意義不明、可能不致病、不致病」 5 個級別。與疾病的遺傳風險有關,存在胚系突變意味著很可能遺傳給下一代。
(5)腫瘤突變負荷(TMB)
腫瘤突變負荷(TMB)是評價基因突變頻率高低的指標。腫瘤突變負荷高,可能意味著免疫治療療效相對好。但是,腫瘤突變負荷低的情況,並不一定意味著免疫治療藥物無效。這時是否使用免疫治療藥物,需要綜合考慮腫瘤具體情況、患者經濟條件、患者主觀意願、獲益的機會和用藥風險。
(6)微衛星不穩定性(MSI)
微衛星不穩定性(MSI)對於多種腫瘤的評估和治療方案的制訂具有重要意義,但在不同腫瘤患者中的意義存在不同,因此這裡不做展開介紹。具體解讀請諮詢醫生。通常情況下,透過免疫組化和 PCR 核酸檢測,即可獲知微衛星不穩定性(MSI),無需為此專門進行 NGS 測序。
(7)質控頁面
總體評估是否合格。 雖然腫瘤NGS測序檢測具有積極的臨床意義,對指導臨床治療用藥有很好的幫助,但是,因為檢測價格相對較高,不能報銷,還有一些基因即使檢測出來,還沒有針對此基因的藥物,所以要根據病情,家庭經濟情況,做出適當選擇,相信不久的將來,每個患者都能做到適合自己的NGS檢測,能用上針對性唯一的藥物,腫瘤得到徹底治癒。