福建農林大學林學院竹資源高效培育與利用協同創新中心教授鄭鬱善團隊、海峽聯合研究院林學中心教授顧連峰團隊利用PacBio平臺，並結合Hi-C技術，採用ALLHiC演算法組裝得到染色體水平的六倍體麻竹分型基因組，該基因組代表了目前已報道竹種中最大的基因組。相關成果近日線上發表於《植物學報》英文版。
麻竹是一種木本叢生竹，生長十分迅速，廣泛種植於南方地區，是重要的筍材兩用竹。特別是在竹子基因功能研究技術系統中，麻竹具有比較成熟的基因過表達體系，因此麻竹適合作為竹子基因功能研究的材料。
然而，麻竹基因組較大，倍性複雜，因此其染色體水平的基因組學研究尚未報道。
聯合團隊的研究將麻竹組裝成三個分型亞基因組，基於轉錄組資訊，並結合相似性和從頭預測等方法，對麻竹三個分型亞基因組共註釋了135231個蛋白質編碼基因，識別了分型染色體之間存在大量遺傳變異，並初步探究了散生竹和叢生竹之間的宏觀共線性關係及部分微觀共線性的差異。
該研究成果為研究亞基因組的進化關係及等位特異性表達奠定了基礎。（記者鄭金武）
相關論文資訊：https://doi.org/10.1111/jipb.13217
來源： 中國科學報
