科技日報北京1月13日電 (實習記者張佳欣)新冠肺炎的許多治療方法都將目標集中在病毒用於與人類細胞結合的刺突蛋白上。雖然這些療法對原始新冠病毒效果很好,但對未來的新變種可能沒有那麼有效。根據近日發表在《科學進展》雜誌上的論文,美國芝加哥大學普利茲克分子工程學院教授胡安·德·巴勃羅的團隊利用先進的計算模擬技術研究了另一種對病毒複製至關重要的蛋白質——Nsp13,它在不同的冠狀病毒中保持相對一致,屬於一類被稱為解旋酶的酶,這種酶在病毒的複製過程中發揮作用。
透過這項工作,科學家們還發現了三種不同的化合物,它們可以與Nsp13結合並抑制病毒複製。鑑於各種冠狀病毒變異株的解旋酶序列的一致性,這些抑制劑可以作為設計靶向解旋酶的新冠肺炎治療藥物的開端。
德·巴勃羅說:“我們目前只有一種治療新冠肺炎的方法,隨著病毒的變異,我們絕對需要針對刺突蛋白之外的不同病毒構建塊。我們的工作揭示了小分子如何能夠在病毒複製中調節一個有吸引力的目標的行為,並表明現有的分子支架是治療新冠肺炎的有希望的候選藥物。”
研究人員發現,蛋白質Nsp13可以將雙鏈DNA解離成兩條單鏈,這是病毒複製過程中的關鍵一步。他們還發現,當外部分子與蛋白質的某些位點結合時,就會擾亂Nsp13中多個結構域的通訊網路。這意味著Nsp13無法再有效地解開DNA,病毒的複製將變得更加困難。
據報道,有幾種化合物可作為Nsp13抑制劑,此次,研究人員選擇了三種化合物進行模擬測試:巴那寧、SSYA10-001和色原酮-4c。他們發現,這三種化合物似乎都能有效破壞Nsp13,因為它們與特定的位點結合,破壞了蛋白質的網路。現在,德·巴勃羅和他的合作者還將在實驗室裡測試他們的結果。
此前,該小組使用計算機分析來揭示藥物依布硒啉是如何與病毒的主要蛋白酶(Mpro)結合的。在另一項研究中,他們還揭示了抗病毒藥物瑞德西韋是如何與病毒結合並干擾病毒的。他們還展示了複合木犀草素是如何抑制病毒的複製能力的。
研究人員稱,他們利用模擬資訊設計了一種治療新冠肺炎的新藥,希望在接下來的幾個月內發表。
德·巴勃羅說:“我們新設計的藥物可能會改變未來治療新冠肺炎的‘遊戲規則’。”