sponsored links

加油血小板

CC 生信人

“新三年舊三年,縫縫補補又三年”,血小板可真是忙了一年又一年。作為“抗洪”主力軍出身的血小板,遇到癌症之後技能表可謂是年年重新整理年年

今天小編給大家分享2篇血小板相關的文章,內容和影響因子真的平易又近人。

第一篇

加油血小板

PDGFRA作為年輕結直腸癌患者治療靶點的作用

IF=5.531

摘要

由於早期診斷和治療的困難,年輕的結直腸癌(CRC)患者與老年患者相比表現出較差的預後。然而,其潛在的分子特徵仍不清楚。作者利用全外顯子組和RNA測序對49名無遺傳性CRC患者的腫瘤和匹配的正常樣本進行了全面分析。作者的研究表明,年輕患者的CRC與CMS4(Consensus molecular subtype 4)和血小板衍生生長因子受體α(PDGFRA)有關。此外,PDGFRA可能服務於新型治療策略的潛力,並代表年輕CRC患者對瑞戈非尼反應的預測性生物標誌物。

背景

在結直腸癌患者中,除遺傳性癌症綜合徵外,一些早髮結直腸癌是由遺傳性基因突變引起的。基因組和轉錄組水平的比較分析將為年輕大腸癌的分子機制提供更多細節和見解。最近,提出了一種更詳細的基於基因表達的大腸癌分類,包括以下四種生物學上不同的一致分子亞型(CMS)[19]:CMS1(微衛星不穩定性(MSI)和免疫啟用)、CMS2(上皮型和標記的WNT訊號)、CMS3(上皮型和代謝失調),和CMS4(間充質型和活化TGF-β訊號)。CMS4的臨床相關性與不良預後相關,而其他的預後相對較好,對單個CMS組的分類對於推進CRC患者的精確醫學具有巨大潛力。

在這項研究中,作者對49例大腸癌患者進行了綜合分析,透過腫瘤和匹配的正常樣本的全外顯子組和RNA測序來了解年輕患者的分子特徵。為了識別年輕大腸癌患者的特異性生物標誌物,作者將樣本分為三組:年輕組(<40歲)、中年組(41-60歲)和老年組(>60歲)。這三組的比較可以區分年輕和老年大腸癌,並揭示更清晰的分子亞型和基因組改變。該研究提供了對年輕大腸癌和新生物標誌物的深入瞭解。

結果

根據結直腸癌患者年齡的CMS分類

加油血小板

圖1基於年齡的CMS型別的差異。a年輕組。b中年組。c老年組

年輕和老年大腸癌的mRNA差異表達和基因譜分析

加油血小板

圖2年輕結直腸癌和老結直腸癌組織之間的差異mRNA表達和基因分析。

a 差異表達基因的火山圖。

b年輕和老年組之間差異表達基因的維恩圖。

c所選基因表達譜的熱圖。

d來自表達中顯著改變的基因的豐富途徑。

e CRC相關突變(錯義、無義和剪接)的Oncoprint。

f樣本中經常檢測到的複製數擴增和缺失

年輕CRC患者中高水平的PDGFRA表達

加油血小板

圖3 PDGFRA在年輕和老年CRC患者中的表達。

a PDGFRA mRNA表達和年齡的散點圖。

b年輕CRC組和老年CRC組中PDGFRA表達水平之間的箱線圖。

c CMS4患者中PDGFRA表達水平的比較。

d按年齡組劃分的三個類別的 CMS 型別餅圖(上圖),以及年輕 CRC 組和老年CRC組中PDGFRA表達水平之間的箱線圖(下圖)

PDGFRA與CMS4相關因子的共表達

加油血小板

圖4 EMT和血管生成因子的共表達。

a PDGFRA和EMT相關特徵之間的基因表達水平散點圖。

b PDGFRA和血管生成相關特徵之間的基因表達水平散點圖。每個點代表一個根據CMS型別著色的樣本。密度圖顯示年輕組和老年組的表達水平比較

患者來源的細胞(PDC)中PDGFRA的表達和PDGFRA靶向藥物反應

加油血小板

圖5 PDC中PDGFRA表達和PDGFRA靶向藥物反應。

a年輕和年老PDC中 PDGFRA表達水平(RT-qPCR)之間的箱線圖。

b年輕和年老PDC中PDGFRA的蛋白質印跡。

c透過敲低年輕患者PDC中PDGFRA的活力。

d透過敲除老年患者PDC中PDGFRA的活力。

e PDC對regorafenib的敏感性。所有用於PDC的患者術前均未接受任何治療

討論

從轉錄組學資料中,作者發現與CMS4相關的PDGFRA在年輕大腸癌患者中明顯高於老年大腸癌患者。當PDGFRA被siRNA下調時,年輕患者PDC的增殖率明顯低於老年PDC。年輕的CRC特異性通路包括PDGFRA訊號傳導、透過VEGF啟用的PDGF受體訊號傳導對細胞增殖的正向調節、細胞趨化性、趨化性調節、PLC活性的正向調節和磷脂醯肌醇磷酸化。這些結果表明PDGFRA可能是年輕大腸癌患者的一個生物標誌物,並且可能在CMS4相關通路中發揮關鍵作用。年輕大腸癌患者的CMS分類可以更好地告知臨床醫生新治療策略的預後和潛力。該研究資料顯示,雷戈拉非尼對PDGFRA上調的年輕大腸癌的PDC更敏感,可能是治療年輕大腸癌患者的潛在候選藥物。

第二篇

(這篇文章之前給大家詳細解讀過,今天簡單回顧一下)

加油血小板

一組血小板相關迴圈長鏈非編碼RNA作為結直腸癌的潛在生物標誌物

IF=5.736

摘要

有證據表明,受腫瘤誘導的血小板(TEPs)有可能成為癌症診斷的生物標誌物庫,但分離的難度限制了它的應用。由於大多數迴圈RNA來自於血小板,血小板中RNA譜系的改變可能導致血清中RNA表達的改變。在本研究中,作者確定了一個血小板相關的長非編碼RNAs(lncRNAs)小組,並評估了其在結直腸癌(CRC)患者血清中的診斷能力,為CRC診斷的血液檢測清單增加了新的lncRNA生物標誌物,併為CRC血小板和血清之間的通訊提供了分子證據。

背景

CRC是第三大常見惡性腫瘤,儘管由於不同的生活方式和飲食特徵,CRC的發病率在全球範圍內有所不同,但新診斷的CRC的上升趨勢在不同地區表現出相似性。先前的研究發現,透過糞便免疫化學試驗(FITs)、結腸鏡篩查、愈創木酚基糞便潛血試驗(gFOBT)和乙狀結腸鏡檢查(柔性乙狀結腸鏡檢查)篩查的患者的結直腸癌死亡率顯著降低。然而,由於價格高、耗時長或感染和腸穿孔風險高,這些篩查方法的廣泛應用受到限制。最近的研究致力於開發新的可用於常規患者監測的血液診斷生物標記物。最近的證據表明,lncRNA生物標記物可以更好地動態檢測癌症狀態,尤其是在血液中。

在本研究中,作者旨在評估大腸癌患者血清中TEP衍生的lncRNAs的表達,並構建具有顯著lncRNAs的診斷模型,以研究其在區分大腸癌患者中的準確性。此外,我們評估了這些迴圈lncRNAs與病理特徵之間的相關性,以探索診斷性lncRNAs的潛在病因機制。

研究設計如圖1所示,本研究包括三個獨立的資料集:發現集、訓練集和個體驗證集。

加油血小板

圖1三階段病例對照研究的流程圖

結果

腫瘤培養血小板中調控異常的lncRNAs的鑑定

加油血小板

圖2 CRC患者和健康對照血小板中的lncRNA表達譜。

A. PCA分析圖顯示了沿PC1和PC2的所有54個樣本。

B.對ANOVA定義的128個差異表達基因進行分層聚類。

C和D.火山圖(C)和MA圖(D)說明了lncRNA配置檔案中資料的分佈

研究人群的特徵

加油血小板

診斷迴圈lncRNAs的建模和評估

加油血小板

圖3訓練集中CRC患者和健康對照血清樣本中4種lncRNA的表達水平和診斷價值。

A.與健康對照相比,CRC患者血清中的LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1上調。

B.透過 ROC 分析計算訓練集中診斷組的AUC和用於診斷CRC的各個lncRNA元件的AUC。

C.訓練集中構建的迴圈lncRNAs判別模型的引數

基於4種lncRNAs模型的驗證

加油血小板

圖4基於4-lncRNAs的模型在驗證集中CRC患者和健康對照的血清樣本中的診斷效能。

A.與健康對照相比,CRC患者血清中的LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1上調。

B透過ROC分析計算診斷組的AUC和驗證集中用於診斷CRC的單個lncRNA元件的AUC

lncRNAs與臨床病理特徵的相關性

加油血小板

討論

血清中的RNA表達水平在很大程度上取決於TEPs。該研究發現,4種lncRNAs(LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1)在大腸癌患者的TEP和血清中均存在失調,具有一致的變異特徵。這一觀察結果表明了這4個lncRNAs在大腸癌發生中的病因學價值,併為闡明TEPs與癌細胞透過血液相互作用提供了新的分子證據。

(這篇文章發了5分,不信也得信!)

無論多少,只要有益於醫藥衛生事業的發展,那就“人間值得”~

加油血小板!加油科研

分類: 情感
時間: 2021-12-04

相關文章

周華健:18歲與初戀失聯,25歲借錢娶外國女粉絲,相伴36年0緋聞

周華健:18歲與初戀失聯,25歲借錢娶外國女粉絲,相伴36年0緋聞
他曾經被譽為"天王殺手". 只要他開演唱會,張學友.劉德華.黎明.郭富城都不敢跟他撞檔. 他演唱會的賣座率一度趕超"四大天王". 這個人就是周華健. 可就是這位 ...

18歲被北大拋棄,25歲成愛爾蘭首位中國伯爵夫人!真實版灰姑娘

18歲被北大拋棄,25歲成愛爾蘭首位中國伯爵夫人!真實版灰姑娘
17年前,中國出現了第一位伯爵夫人: 她是位天津姑娘,林曉靜. 這新聞在當時火爆全網,網友紛紛搜尋資料,想扒一扒伯爵夫人的戀愛往事. 可沒想到的是,眾人眼中浪漫的皇室婚姻,竟然始於一場"騙局 ...

NBA三訊息:克萊有望打出高水準;25歲以下球星排名,東契奇居首

NBA三訊息:克萊有望打出高水準;25歲以下球星排名,東契奇居首
今天是星期六,也是農曆8月12號,在這裡小編先祝大家中秋節快樂.同時NBA也有了新的訊息.濃眉有望新賽季觸底反彈,重返巔峰:專家看好克萊新賽季打出高水準,同時美媒也評選出了NBA25歲以下的25大球星 ...

68歲法國第一夫人是怎麼用氣質碾壓25歲美國超模的?

68歲法國第一夫人是怎麼用氣質碾壓25歲美國超模的?
有人說法國女人穿得更好,未必這句話就代表普遍真理,但#法國總統夫人#再次證明法國女人肯定比美國女人有氣質,68歲的#布麗吉特·馬克龍#完勝#海莉·比伯#. 25歲的超模海莉在68歲的布麗吉特襯托下,顯 ...

戰狼:龍小云25歲已是正團級中校?吳京沒把軍銜搞明白,鬧了烏龍

戰狼:龍小云25歲已是正團級中校?吳京沒把軍銜搞明白,鬧了烏龍
戰狼:龍小云25歲已是正團級中校?吳京沒把軍銜搞明白,鬧了烏龍 <戰狼>系列看的真是過癮,看了第一部,就忍不住想看第二部. 兩隻"狼"看完後,盼星星盼月亮的等著第三部, ...

因抑鬱症自殺的6位明星,每一位都讓人心痛,最小的年僅25歲

因抑鬱症自殺的6位明星,每一位都讓人心痛,最小的年僅25歲
深受抑鬱症困擾的明星太多了! 大多數都選擇了自殺,結束自己痛苦的一生,在這些明星中,每一位都讓人心痛,最小的年僅25歲. 喬任梁:28歲 9月16日,是喬任梁去世五週年的日子,昔日好友陳喬恩,連續五年 ...

申通創始人聶騰飛:22歲白手起家,25歲不幸去世,公司歸了大舅哥

申通創始人聶騰飛:22歲白手起家,25歲不幸去世,公司歸了大舅哥
隨著電商行業的蓬勃發展,人們網購的頻率越來越高,我們的生活也已經被大大小小的快遞所包圍,幾乎每過兩三天就會收到大箱小箱的快遞,目前大家熟知的快遞企業莫過於三通一達,即我們經常見到的:申通.圓通.中通. ...

CBA2021-2022賽季25歲以下最好的五名年輕球員,胡金秋穩居第一

CBA2021-2022賽季25歲以下最好的五名年輕球員,胡金秋穩居第一
CBA這幾年出色的年輕球員並不少,雖然不足以在國際賽場上立足,也不足以登陸 NBA這樣的大舞臺.但是在CBA他們依舊是聯賽最好最有天賦的年輕球員,讓我們看看CBA下賽季25歲以下最好的五名球員(不包含 ...

大力出奇跡?杭州25歲小夥健身過度致橫紋肌溶解

大力出奇跡?杭州25歲小夥健身過度致橫紋肌溶解
生活中我們常常覺得"大力出奇跡",但健身也如此嗎?答案是否定的. 25歲的小余近期體重增加較快,身體質量指數BMI即將達到肥胖標準,於是下決心突擊減肥.經過兩週的加強訓練,從來沒有 ...

他25歲保送清華,11年少將升中將,父親是元帥,岳父是開國少將

他25歲保送清華,11年少將升中將,父親是元帥,岳父是開國少將
戰爭讓中華大地滿目瘡痍,中國近代,在經歷過抗日戰爭.解放戰爭後,才讓中國重新統一起來,國人也免受戰爭的痛苦.在那個時代裡,有許許多的年輕人,他們的夢想都是為了新中國的崛起而努力奮鬥著. 為了實現自己的 ...

伊藤鬱子:25歲嫁中國軍人,47歲回家辭別老母親:我的心在中國

伊藤鬱子:25歲嫁中國軍人,47歲回家辭別老母親:我的心在中國
"我來中國是為了贖罪,為了替日本人還債,日本人欠你們的太多了--" --伊藤鬱子 抗日戰爭進行到1945年時,日本的敗局已定,可日本士兵在軍國主義的影響下,始終都不願意相信這一事實 ...

25歲,開始焦慮了

25歲,開始焦慮了
大家好,我是升升,如果喜歡我寫的內容,就點贊關注吧. 畢業兩年後,看著身邊的同學和朋友,陸續開始結婚,甚至有些同學還有了孩子. 而至今單身的我,開始焦慮了. 25歲,對女生來說,是一個非常尷尬的年齡. ...

美媒列出了2021-22賽季25歲以下最好的二人組,艾頓布克僅第三

美媒列出了2021-22賽季25歲以下最好的二人組,艾頓布克僅第三
現在的聯盟是超級球隊的時代,每支出色的球隊都擁有出色的二人組,或者三巨頭.但是基本這些超級球隊擁有的最強組合,都是一些老將組成的,特別是籃網和湖人的最強組合.因此,美媒<Fadeawaywor ...

NBA25大25歲以下球員,東契奇、塔圖姆還有特雷楊排名前三

NBA25大25歲以下球員,東契奇、塔圖姆還有特雷楊排名前三
Bleacher Report評選出了NBA25大25歲以下球員,東契奇.塔圖姆還有特雷楊排名前三. 具體排位:1.盧卡-東契奇(22歲),2.傑森-塔圖姆(23歲),3.特雷-楊(22歲),4.錫安 ...

在CBA打過球的NBA球員過得如何?一人25歲無球可打,一人將拿頂薪

在CBA打過球的NBA球員過得如何?一人25歲無球可打,一人將拿頂薪
國際球員來CBA打球除了撈金以外就是鍛鍊自己的競技狀態尋找機會回到NBA的大舞臺.畢竟CBA和NBA是兩個級別的聯賽:先不說薪水高低,NBA的曝光率是全世界的,是國際舞臺.那在CBA打過球的被NBA球 ...

火箭1500萬籤3+3後衛,沃西談濃眉打中鋒,25歲25大新星排名出爐

火箭1500萬籤3+3後衛,沃西談濃眉打中鋒,25歲25大新星排名出爐
北京時間9月19日,隨著訓練營的臨近,現在各支球隊對於自己球隊大名單最後的補充開始了運作,據美媒透露達倫科裡森在等湖人一份訓練營合同,而火箭今天則簽下了一位26歲的控衛來填充名單,沃西談到了新賽季濃眉 ...

俄羅斯25歲男子為變超人,大臂注射6升類固醇,為保命上了手術檯

俄羅斯25歲男子為變超人,大臂注射6升類固醇,為保命上了手術檯
現年25歲的俄羅斯男子基里爾·捷列辛(Kirill Tereshin),曾經是一名士兵,和很多熱愛健身的男士一樣,基里爾對健壯的二頭肌很是痴迷,夢想著自己能變成超人那般魁梧.不過基里爾把夢想照進現實的 ...

湖人又有年輕人入隊啦!才25歲呀

湖人又有年輕人入隊啦!才25歲呀
沒有等來科裡森,來了一個奧利弗? 前兩天湖人與卡梅隆-奧利弗簽下一份Exhibit 10合同.本以為是個老將,仔細一看,原來是上賽季跟火箭隊簽過短約的年輕小夥. 奧利弗今年25歲,身高2米03,臂展2 ...

著名主持人魏笑,25歲僅當36小時新娘不幸離世,丈夫為愛至今不娶

著名主持人魏笑,25歲僅當36小時新娘不幸離世,丈夫為愛至今不娶
一. 她是鏡頭前端莊知性的女主持,也是生活裡愛笑樂觀的漂亮女孩! 卻與相戀十年男友領完結婚證的第二天,僅做了36個小時的新娘就突然離世! 婚禮變葬禮! 25歲的著名主持人魏笑,就這樣永遠離開了我們,令 ...

美媒評現役25歲以下五大雙人組:布克艾頓僅第三,錫安鶯歌居次席

美媒評現役25歲以下五大雙人組:布克艾頓僅第三,錫安鶯歌居次席
隨著聯盟在商業化方面不斷取得成功,球迷與媒體對球員抱團行為的閾值也在不斷提高,一人一城早已成為陳年舊曆. 加上聯盟爭冠激烈程度不斷提升,想要單核贏得冠軍的難度可想而知,上一次單核奪冠還要追溯到2011 ...