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“新三年舊三年,縫縫補補又三年”,血小板可真是忙了一年又一年。作為“抗洪”主力軍出身的血小板,遇到癌症之後技能表可謂是年年重新整理年年
今天小編給大家分享2篇血小板相關的文章,內容和影響因子真的平易又近人。
第一篇
PDGFRA作為年輕結直腸癌患者治療靶點的作用
IF=5.531
摘要
由於早期診斷和治療的困難,年輕的結直腸癌(CRC)患者與老年患者相比表現出較差的預後。然而,其潛在的分子特徵仍不清楚。作者利用全外顯子組和RNA測序對49名無遺傳性CRC患者的腫瘤和匹配的正常樣本進行了全面分析。作者的研究表明,年輕患者的CRC與CMS4(Consensus molecular subtype 4)和血小板衍生生長因子受體α(PDGFRA)有關。此外,PDGFRA可能服務於新型治療策略的潛力,並代表年輕CRC患者對瑞戈非尼反應的預測性生物標誌物。
背景
在結直腸癌患者中,除遺傳性癌症綜合徵外,一些早髮結直腸癌是由遺傳性基因突變引起的。基因組和轉錄組水平的比較分析將為年輕大腸癌的分子機制提供更多細節和見解。最近,提出了一種更詳細的基於基因表達的大腸癌分類,包括以下四種生物學上不同的一致分子亞型(CMS)[19]:CMS1(微衛星不穩定性(MSI)和免疫啟用)、CMS2(上皮型和標記的WNT訊號)、CMS3(上皮型和代謝失調),和CMS4(間充質型和活化TGF-β訊號)。CMS4的臨床相關性與不良預後相關,而其他的預後相對較好,對單個CMS組的分類對於推進CRC患者的精確醫學具有巨大潛力。
在這項研究中,作者對49例大腸癌患者進行了綜合分析,透過腫瘤和匹配的正常樣本的全外顯子組和RNA測序來了解年輕患者的分子特徵。為了識別年輕大腸癌患者的特異性生物標誌物,作者將樣本分為三組:年輕組(<40歲)、中年組(41-60歲)和老年組(>60歲)。這三組的比較可以區分年輕和老年大腸癌,並揭示更清晰的分子亞型和基因組改變。該研究提供了對年輕大腸癌和新生物標誌物的深入瞭解。
結果
根據結直腸癌患者年齡的CMS分類
圖1基於年齡的CMS型別的差異。a年輕組。b中年組。c老年組
年輕和老年大腸癌的mRNA差異表達和基因譜分析
圖2年輕結直腸癌和老結直腸癌組織之間的差異mRNA表達和基因分析。
a 差異表達基因的火山圖。
b年輕和老年組之間差異表達基因的維恩圖。
c所選基因表達譜的熱圖。
d來自表達中顯著改變的基因的豐富途徑。
e CRC相關突變(錯義、無義和剪接)的Oncoprint。
f樣本中經常檢測到的複製數擴增和缺失
年輕CRC患者中高水平的PDGFRA表達
圖3 PDGFRA在年輕和老年CRC患者中的表達。
a PDGFRA mRNA表達和年齡的散點圖。
b年輕CRC組和老年CRC組中PDGFRA表達水平之間的箱線圖。
c CMS4患者中PDGFRA表達水平的比較。
d按年齡組劃分的三個類別的 CMS 型別餅圖(上圖),以及年輕 CRC 組和老年CRC組中PDGFRA表達水平之間的箱線圖(下圖)
PDGFRA與CMS4相關因子的共表達
圖4 EMT和血管生成因子的共表達。
a PDGFRA和EMT相關特徵之間的基因表達水平散點圖。
b PDGFRA和血管生成相關特徵之間的基因表達水平散點圖。每個點代表一個根據CMS型別著色的樣本。密度圖顯示年輕組和老年組的表達水平比較
患者來源的細胞(PDC)中PDGFRA的表達和PDGFRA靶向藥物反應
圖5 PDC中PDGFRA表達和PDGFRA靶向藥物反應。
a年輕和年老PDC中 PDGFRA表達水平(RT-qPCR)之間的箱線圖。
b年輕和年老PDC中PDGFRA的蛋白質印跡。
c透過敲低年輕患者PDC中PDGFRA的活力。
d透過敲除老年患者PDC中PDGFRA的活力。
e PDC對regorafenib的敏感性。所有用於PDC的患者術前均未接受任何治療
討論
從轉錄組學資料中,作者發現與CMS4相關的PDGFRA在年輕大腸癌患者中明顯高於老年大腸癌患者。當PDGFRA被siRNA下調時,年輕患者PDC的增殖率明顯低於老年PDC。年輕的CRC特異性通路包括PDGFRA訊號傳導、透過VEGF啟用的PDGF受體訊號傳導對細胞增殖的正向調節、細胞趨化性、趨化性調節、PLC活性的正向調節和磷脂醯肌醇磷酸化。這些結果表明PDGFRA可能是年輕大腸癌患者的一個生物標誌物,並且可能在CMS4相關通路中發揮關鍵作用。年輕大腸癌患者的CMS分類可以更好地告知臨床醫生新治療策略的預後和潛力。該研究資料顯示,雷戈拉非尼對PDGFRA上調的年輕大腸癌的PDC更敏感,可能是治療年輕大腸癌患者的潛在候選藥物。
第二篇
(這篇文章之前給大家詳細解讀過,今天簡單回顧一下)
一組血小板相關迴圈長鏈非編碼RNA作為結直腸癌的潛在生物標誌物
IF=5.736
摘要
有證據表明,受腫瘤誘導的血小板(TEPs)有可能成為癌症診斷的生物標誌物庫,但分離的難度限制了它的應用。由於大多數迴圈RNA來自於血小板,血小板中RNA譜系的改變可能導致血清中RNA表達的改變。在本研究中,作者確定了一個血小板相關的長非編碼RNAs(lncRNAs)小組,並評估了其在結直腸癌(CRC)患者血清中的診斷能力,為CRC診斷的血液檢測清單增加了新的lncRNA生物標誌物,併為CRC血小板和血清之間的通訊提供了分子證據。
背景
CRC是第三大常見惡性腫瘤,儘管由於不同的生活方式和飲食特徵,CRC的發病率在全球範圍內有所不同,但新診斷的CRC的上升趨勢在不同地區表現出相似性。先前的研究發現,透過糞便免疫化學試驗(FITs)、結腸鏡篩查、愈創木酚基糞便潛血試驗(gFOBT)和乙狀結腸鏡檢查(柔性乙狀結腸鏡檢查)篩查的患者的結直腸癌死亡率顯著降低。然而,由於價格高、耗時長或感染和腸穿孔風險高,這些篩查方法的廣泛應用受到限制。最近的研究致力於開發新的可用於常規患者監測的血液診斷生物標記物。最近的證據表明,lncRNA生物標記物可以更好地動態檢測癌症狀態,尤其是在血液中。
在本研究中,作者旨在評估大腸癌患者血清中TEP衍生的lncRNAs的表達,並構建具有顯著lncRNAs的診斷模型,以研究其在區分大腸癌患者中的準確性。此外,我們評估了這些迴圈lncRNAs與病理特徵之間的相關性,以探索診斷性lncRNAs的潛在病因機制。
研究設計如圖1所示,本研究包括三個獨立的資料集:發現集、訓練集和個體驗證集。
圖1三階段病例對照研究的流程圖
結果
腫瘤培養血小板中調控異常的lncRNAs的鑑定
圖2 CRC患者和健康對照血小板中的lncRNA表達譜。
A. PCA分析圖顯示了沿PC1和PC2的所有54個樣本。
B.對ANOVA定義的128個差異表達基因進行分層聚類。
C和D.火山圖(C)和MA圖(D)說明了lncRNA配置檔案中資料的分佈
研究人群的特徵
診斷迴圈lncRNAs的建模和評估
圖3訓練集中CRC患者和健康對照血清樣本中4種lncRNA的表達水平和診斷價值。
A.與健康對照相比,CRC患者血清中的LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1上調。
B.透過 ROC 分析計算訓練集中診斷組的AUC和用於診斷CRC的各個lncRNA元件的AUC。
C.訓練集中構建的迴圈lncRNAs判別模型的引數
基於4種lncRNAs模型的驗證
圖4基於4-lncRNAs的模型在驗證集中CRC患者和健康對照的血清樣本中的診斷效能。
A.與健康對照相比,CRC患者血清中的LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1上調。
B透過ROC分析計算診斷組的AUC和驗證集中用於診斷CRC的單個lncRNA元件的AUC
lncRNAs與臨床病理特徵的相關性
討論
血清中的RNA表達水平在很大程度上取決於TEPs。該研究發現,4種lncRNAs(LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1)在大腸癌患者的TEP和血清中均存在失調,具有一致的變異特徵。這一觀察結果表明了這4個lncRNAs在大腸癌發生中的病因學價值,併為闡明TEPs與癌細胞透過血液相互作用提供了新的分子證據。
(這篇文章發了5分,不信也得信!)
無論多少,只要有益於醫藥衛生事業的發展,那就“人間值得”~
加油血小板!加油科研