CFU(Colony-Forming Units) "菌落形成單位"指單位體積中的細菌、黴菌、酵母等微生物的群落總數。在活菌培養計數時，由單個菌體或聚整合團的多個菌體在固體培養基上生長繁殖所形成的集落，稱為菌落形成單位，以其表達活菌的數量。菌落形成單位的計量方式與一般的計數方式不同，一般直接在顯微鏡下計算菌體數量會將活與死的菌體全部算入，但是CFU只計算活的菌體數量。
菌落的個數，傳統上叫"個"。但是，一個菌落並不一定是一個微生物所生成，也可能是由一簇微生物(一個微生物菌團)所生成，因此叫"個"不太準確，準確的叫法是"菌落形成單位"。
按照CFU的概念，微生物平板菌落檢測樣品處理時對樣品的分散要求是越充分越好，儘量保證聚整合團的菌體分散成單個菌體，這樣才能保證樣品檢測的真實性、準確性。
國標和部標規定為了樣品充分分散，在固體樣品檢測時稱取一定的樣品加入含有吐溫80和玻璃珠的定量無菌水中，常溫搖床震盪30min後稀釋測樣
在固體發酵的芽孢桿菌樣品檢測時，我們發現按照標準方法處理樣品，往往造成樣品檢測含量偏低。主要原因是因為芽孢桿菌固體發酵採用糧食原料，產品烘乾後，芽孢與殘留的澱粉、蛋白質形成膠體團，採用常規方法處理樣品較難形成單一的芽孢。所以，在固體發酵芽孢產品檢測時，我們對樣品處理做了改良，增加了熱水浴程式，讓芽孢、澱粉和蛋白質膠團充分溶解釋放，最大程度的獲得單一芽孢個體，保證產品檢測真實性。
具體程式如下：
固體發酵芽孢樣品稱樣→加入裝有玻璃珠的含吐溫80定量無菌水搖瓶→65℃水浴30min→搖床震盪30min→稀釋→塗布平皿→培養→計數
