1944年9月初，饒漱石（前左3）、張雲逸（前左4）、賴傳珠（前左5）等與美國飛行員合影。
從1944年1月起，華中局推廣華中黨校的整風經驗，部署軍直和各戰略區採取“機關學校化”的辦法，舉辦整風隊和堅持在職整風並舉，取得了很好的效果。同年4月，華中局召開整風會議，饒漱石在總結報告中著重強調了整風審幹階段的政策和策略問題。在此前的1943年，延安在康生的具體主持下開展所謂的“搶救運動”，要求各級黨委認真執行。在饒漱石召開的有關整風工作會議上，黃克誠率先反對搞“搶救運動”，經過討論，為了穩妥起見，決定先抽調一批幹部辦訓練班，同時在第七旅小範圍內試行“搶救失足者”，並由黃克誠到該旅實地考察，掌握動向。事實很快證明，搞“搶救運動”的做法行不通。第七旅被“搶救”的幾個人，開始在軟逼的情況下就有點不正常，後來被抓起來一審訊，就亂供一氣簡直不著邊際。在黃克誡等人的建議下，饒漱石果斷停止“搶救運動”，對被“搶救”的幹部進行甄別平反。正當此時，康生從延安來電，說有人交代新四軍第三師保衛部長揚帆參加了特務組織，要立即逮捕審訊。饒漱石立即致電三師師長黃克誠，要他將揚帆逮捕並送華中局。饒漱石對這事非常慎重，專門成立了由他任組長、潘漢年等為成員的審查小組，並指定由潘漢年負責搞清揚帆的問題。專案組先後對揚帆進行了多次審訊，揚帆堅持四條原則，一不亂供、二不逃跑、三不自殺、四守監規。潘漢年經過多方調查，認為揚帆不可能是特務分子，便向饒漱石彙報。饒漱石親自到監獄把揚帆放了出來，當場向揚帆道歉說：“對不起，揚帆同志，是我們錯了，讓你受委屈了。”鑑於揚帆在關押期間身體極度虛弱，饒漱石要揚帆好好休養，每月補給他50元生活費。不久，華中局成立敵區工作部，饒漱石任命揚帆為部長。由於注意掌握政策，整個華中整風一般地說沒有出現大的問題。即如淮北根據地的“泗陽案件”和“淮北中學案件”，也由於華中局、軍部和淮北區黨委的及時發現和糾正，挽回了影響。到1945年春，華中整風進入第三階段。根據黨中央的部署，華中局和軍部在3月發出整風善後工作指示，要求各區黨委總結經驗鞏固成果，對整風審幹中出現的遺留問題一一複查甄別，實事求是地作出了妥善處理。
饒漱石領導了華中地區的大生產運動。為了克服華中根據地極端嚴重的困難局面，貫徹黨中央開展大生產運動的指示，華中局於1943年9月30日發出《關於生產運動的指示》，把開展大生產運動作為根據地建設的中心工作。1944年4月1日再次發出《關於開展軍民生產運動的指示》。饒漱石、張雲逸等領導人帶頭開荒種地。在大生產運動中，按照作戰部隊、地方武裝、後方機關等不同情況，制定了以農副產品及日用品的自給、半自給為目標的生產計劃。經過一年努力，華中新四軍物質生活有了明顯改善，軍直機關幹部不僅做到食油、蔬菜自給，生活日用品也做到基本自給；新四軍第二師生產的飛馬牌香菸暢銷上海等地。新四軍生產的手榴彈做到自給，部隊的戰鬥力也有了較大提高。
為了增強部隊作戰能力，迎接即將到來的戰略反攻，中共中央於1944年7月1日發出《關於整訓軍隊的指示》，向全軍提出加緊訓練現有部隊的任務。8月22日，毛澤東、劉少奇、陳毅在延安聯名致電饒漱石、張雲逸，指出華中部隊整訓應著重練兵、帶兵、養兵、用兵四大項，而以練兵為中心；採取官教兵、兵教兵、兵教官的方法，練好射擊、投彈、刺殺和土木作業四大技術；在整訓中要提高幹部的作戰指揮藝術和管理教育部隊的能力。這是為了適應抗戰爭形勢的發展，為戰略反攻預作準備。在華中局和軍部的統一部署下，依據黨中央指示精神，華中各部隊從1944年冬起分期分批開展了軍政訓練。在以練兵為中心的整訓中，還開展了運動戰、攻堅戰、步炮協同、爆破登城等內容的訓練。這期間，還注重了對幹部的培養，僅在抗大各分校受訓的學員就達5000餘人。在抓好主力部隊整訓的同時，又抓了民兵和自衛隊的整組和訓練，開展了創造民兵英雄的活動。透過整訓，軍政機關的面貌煥然一新，部隊指戰員的指揮水平和軍事技術有了極大提高，地方武裝和民兵建設也得到了加強。1944年冬至1945年春，各地為壯力大新四軍主力部隊，準備反攻作戰，掀起了轟轟烈烈的參軍熱潮，僅淮南、蘇北及蘇中第一軍分割槽就有3.8萬餘人自願參軍。
在領導部隊開展整訓的同時，華中新四軍在饒漱石、張雲逸和參謀長賴傳珠的指揮下，發起了進軍河南、發展東南、鞏固淮南津浦路西的一系列戰役，以適應抗日戰爭從戰略相持向戰略反攻轉變的形勢。在進軍河南戰役中，新四軍西進部隊在4個月作戰中共計拔除據點36處，粉碎敵偽頑配合的兩次“掃蕩”，解放了東起津浦路、北至隴海路、南至渦河、西至商（丘）毫（縣）公路，東西300餘里、南北200餘里廣大國土上的750萬人民。1944年12月和1945年4月，新四軍軍部先後派第一師師長粟裕、副師長葉飛率主力南渡長江，在長興組成新四軍蘇浙軍區。部隊在浙西天目山區先後粉碎國民黨頑軍三次大規模武裝進攻，殲滅頑軍一萬人，進一步鞏固了蘇浙根據地，建立了江南新四軍準備實施戰略反攻的前進陣地。1945年3月，國民黨桂系軍隊增調兵力1.3萬餘人進攻淮南津浦路西新四軍第二師譚震林部。為確保自衛反擊戰役勝利，饒漱石、張雲逸親自率軍部精幹指揮機關赴淮南路西，參與制定作戰方案，在4月12日的旅以上幹部會上確定了以優勢兵力攻其據點打援，迫其西撤，在追擊中爭取再殲其一部以徹底解決路西問題的戰役決策。戰鬥從4月I4日晚打響，至4月20日，新四軍經六晝夜激戰，殲桂軍3600餘人，取得淮南路西自衛反擊戰的勝利。
7月26日，美、英、中三國發表波茨坦公告，促令日本政府無條件投降。8月8日，蘇聯政府宣佈對日作戰。8月9日，毛澤東發表《對日寇的最後一戰》宣告。8月10日至11日，朱德總司令連續釋出受降及對日展開全面反攻等命令。在戰略大反攻階段，華中局和新四軍軍部將中共中央的作戰部署及時轉發各師、各軍區，並決定各主力師、旅不再兼任軍區、軍分割槽，以加強野戰機動進攻能力。從8月10日起，新四軍各部在華中敵後發起旨在奪取敵佔中小縣城和廣大鄉村的猛烈進攻。至9月初日本向同盟國簽署無條件投降書，華中新四軍的全面反攻取得了巨大勝利，共解放縣城32座和400餘個重要集鎮，殲日偽軍2.8萬餘人，基本上完成了對武漢外圍的廣闊地區、太湖、天目山之間廣大鄉村及許多縣城的佔領，初步實現將蘇中、蘇北、淮南、淮北根據地打成一片的任務。此後，新四軍對拒不投降的日偽軍繼續發動攻擊，取得了兩淮（淮陰、淮安）、鹽城、高郵等戰役的勝利。從9月6日到12月26日的100多天作戰中，新四軍又解放縣城13座，殲滅盤踞在蘇北、蘇中、淮南、淮北地區的偽軍四萬餘人，迫使偽軍一萬餘人起義，斃俘拒降日軍1200餘人，拔除了殘存在華中解放區內的全部日偽軍據點。
1945年4月23日至6月11日，中共七大在延安召開，饒漱石當選為中央委員。8月25日，陳毅率部分在延安的新四軍幹部啟程回華中。26日，中共中央任命陳毅為新四軍軍長、華中局副書記，饒漱石為新四軍政治委員、華中局書記。
連結：新四軍歷任首長——政治委員饒漱石（11）
新四軍歷任首長——政治委員饒漱石（10）
