一個國際科學家團隊創造了一種強大的新資源,以加快開發疫苗和治療方法,對抗下一次大流行。弗吉尼亞大學醫學院研究員Wladek Minor博士與中國和波蘭的合作者開發了一個網際網路資訊系統,稱為virusMED,它列出了我們所知道的關於75個不同病毒家族的800多個病毒株的原子結構和潛在的脆弱性,包括SARS-CoV-2、流感、埃博拉和HIV-1。包括首席調查員鄭和平在內的幾位合作者是Minor在弗吉尼亞大學實驗室的前學生和成員。
這種潛在威脅的蛋白質的新全景將幫助科學家們快速有效地應對下一個準備對人類造成破壞的病原體。Minor和他的合作者將這一資源與Google地圖相提並論,因為它組織並註釋了病毒的主要興趣點,科學家可以將其作為藥物和疫苗開發的路線圖。
“與COVID-19的戰鬥還沒有結束,但我們已經迫不及待地開始為下一次大流行病做準備。”弗吉尼亞大學分子生理學和生物物理學哈里森特聘教授Minor說:“VirusMED是向先進的資訊系統邁出的一步,該系統將具有不同專長的研究人員聚集在一起,應對複雜的生物醫學挑戰。virusMED中包含的資訊將幫助來自許多學科的病毒研究人員,特別是那些從事藥物設計或抗病毒治療的研究人員。我們提供新穎的結構分析,並整合來自各種資源的相關資訊,以提供蛋白質最重要和最脆弱區域的全面情況。”
透過迅速解開SARS-CoV-2病毒的作用機制,科學家們能夠為COVID-19開發安全有效的疫苗。Minor的新資料庫旨在將這類關鍵資訊放在一個方便的位置,讓科學家們觸手可及。
VirusMED包含關於病毒種類和毒株、宿主、病毒蛋白和抗體的廣泛資訊,以及已經被美國食品和藥物管理局(FDA)批准的藥物,以及其他重要的科學資料。研究人員將病毒上的興趣點稱為“熱點”,而這些“熱點”是藥物和疫苗開發的有力起點。
Minor實驗室的研究人員David Cooper博士說:“為治療COVID-19而開發的最有前途的毒株不同的抗體療法之一,就是利用這類資訊來改進早在2003年從一名被SARS病毒感染的倖存者身上分離出來的獨特抗體。那些對快速藥物和疫苗設計感到驚訝的人沒有意識到,今天的研究人員是在以前幾十年的研究基礎上進行的。”
Minor說,virusMED的主要優勢之一是它將有關病毒的現有知識彙集到一個地方。以前,這些資料分散在多個資源中,而且往往是“孤島”"式的,因此不容易獲取。透過virusMED,研究人員可以按病毒或他們感興趣的“熱點”來瀏覽資訊。
這個免費的、供所有人使用的資料庫可以在https://virusmed.biocloud.top獲得。
“我的實驗室的目標之一是製作其他科學家可以使用的工具。我們著眼於森林,並找到幫助他人關注樹木的方法,”Minor說。“資源生成並不迷人,但科學的最終目標是讓生活變得更好。該論文的一位匿名同行評審員聲稱他們立即成為該系統的熱心使用者。我們期望virusMED真的能帶來改變。”