文|陳根
CRISPR技術具有精準、廉價、強大、易於使用的特點。這種工程能把一段作為引導工具的小RNA切入DNA,並在此處切斷或做其他改變。以往研究表明,透過這些介入,CRISPR能使基因組更有效地產生變化或突變,效率比TALEN(轉錄啟用因子類感受器核酸酶)等其他基因編輯技術更高。
CRISPR的突破性進展,很大一部分歸功於一種名叫Cas9的特殊程式設計酶。工程編輯系統利用這種酶,能發現、切除並取代DNA的特定部分。從改變老鼠皮毛的顏色,到設計不傳播瘧疾的蚊子和抗蟲害作物,再到修正鐮狀細胞性貧血等各類遺傳疾病等,這種技術的影響極其深遠。
雖然CRISPR有許多優點,但在人類癌細胞系列中,其可能產生大量“誤傷目標”,尤其是對不希望改變的基因做修改。而且它們尺寸往往較大,不容易直接送入活的生物體、細胞和組織內。
為此,此前斯坦福的研究人員開發了一個體積更小的基因編輯系統,命名為CasMINI。傳統的CRISPR系統,如果使用1000個氨基酸的Cas9,以及使用1500個氨基酸的Cas12a;相比之下,CasMINI只有529個氨基酸,但二者編輯遺傳密碼的效力卻難分伯仲。
近日,麻省理工學院的科學家們在新的研究中,發現了CRISPR之外的一類全新的酶,它們具有同樣的基因編輯能力,甚至可能在某些方面勝過CRISPR。該系統被命名為Obligate Mobile Element Guided Activity(OMEGA)。
IscB蛋白具有DNA切割酶的外觀,但不知道其是否參與了CRISPR,或與RNA有關。經過研究,科學家們發現附近的RNA能夠引導IscB蛋白在某些地方切割DNA。
此外,科學家們確定了另外兩種利用ωRNAs的蛋白質——IsrBs和TnpBs。這三種蛋白質都存在於被稱為轉座子的“跳躍基因”中,它們可以在基因組中移動,並會建立一個新的引導RNA,讓酶切割DNA的不同部分。
科學家們設計了OMEGA系統,這種機制可以構成一個全新的基因編輯系統基礎,並在人類細胞中工作。值得一提的是,由於RNA的大小隻有CRISPR酶的30%左右,從而可能更容易進入細胞。
目前,這項研究發表在《科學》雜誌上。