1、西遷
阿勒坦汗曾率右翼諸部用兵西海(即甘肅、青海)地區。1543年(嘉靖二十二年)，阿勒坦汗第三次征伐衛剌特，徹底征服卜爾孩及其部眾，同時戰勝撒拉衛郭爾部，將ト爾孩之部眾賜於其侄岱青諾延(即永邵ト大成臺吉)。1558年(嘉靖三十七年)，阿勒坦汗第四次用兵西海，收服殘餘的衛郭特部，佔據衛郭特、番、撒拉衛郭爾等部族的牧地(即甘、青一帶的安定四衛地)，留其四子丙圖等數萬眾駐守該地。這是遷徙到西海一帶駐牧的第一批土默特部眾。此後，右翼諸部又陸續遷徙許多部眾到甘青地區。1577年(萬曆五年)，阿勒坦汗帶領大批部眾赴西海，第二年的恰布齊雅勒會晤之後，留多羅土蠻部的火落赤合吉、永謝布的巴爾戶及其部眾駐牧西海地區。都隆森格繼位後，於1582年(萬曆十年)派多羅土蠻的達延洪臺吉(即把都兒黃合吉)、蒙古勒津的阿齊賴固什、永謝布、喀喇沁的固什莫德格沁和塔必太古英等率部前往西藏迎請三世達賴喇嘛，其中達延洪臺吉所部即留在西海地區。據《萬曆武功錄》載，到1586年(萬曆十四年)，土默特部在西海地區駐牧的首領有火落赤臺吉、哈炭把都兒臺吉、威正阿拜臺吉、麥力艮合吉、哈喇各カ臺吉、土骨赤臺吉、阿榜臺吉、龍合臺吉等，還有《武備志》記載的真相臺吉、克抽臺吉，以及鄂爾多斯部的鐵雷(切盡黃臺吉之侄)、那木大臺吉等，他們成了安多和康(即甘南、青海、川西)廣大地區的領主。
1590年(萬曆十八年)發生“洮河事件”，駐牧西海地區的土默特部眾受挫，扯力克汗率眾東還土默川，恰布齊雅廟亦被明軍焚燬，但原駐西海的右部眾仍在彼遊牧。宜大總督鄭洛在《敬陳備禦海事宜以弭後慮疏》中說，火落赤等始來肅州之南時，“僅三四萬騎，已而收武宗塔兒番子，已而收剌卜番子，已而渡歸德收哈家諸番子”。《崇禎長編)則說:“海部兄弟十八支，兵數十萬”，“數十年來生聚訓練，志已非小”。17世紀30年代，駐牧西海一帶的右翼蒙古族逐漸衰落，但直到清代，青海玉樹等處仍有右翼蒙古遊牧，如苦扎地方的雍熙葉布(即永謝布)和蒙古爾津地方的蒙古爾津(即蒙古勒津)等。
2、東遷
16世紀30至40年代，土默特部迅速強大，據《阿勒坦汗傳》記載，約當1542至1544年(嘉靖二十ー至ニ十三年)之間，烏濟葉特部(即福餘衛，也即往流或岡流部)的恩克丞相率部歸附阿勒坦汗。1549年(嘉ニ十八年)左右阿勒坦汗率右翼諸部征服朵衛影克等，阿將其賜予其弟昆都倉汗(即巴雅恩哈勒)，此後土默特部和喀喇沁部進一步向東擴充套件，把相當一部分朵顏、泰寧、福餘三衛部眾從中央汗庭控制下爭奪過來。
阿勒坦汗之長子都隆森格洪臺吉原駐牧於宣府大同以北，與喀喇沁部眥。他向東擴充套件勢力主要有兩種方式，即武力征服和聯煙。《萬曆武功錄》說黃臺吉於1547年(嘉靖ニ十六年)“提精兵走薊、遼，而獨石、古北、潮河之間蕭然苦兵矣”。都隆森格此前就曾攻略朵顏衛伯彥帖忽思和把卜亥等部，收服了若干朵顏衛部眾。據《薊門考》記載，1567年(隆慶元年)，因都隆森格索要牛馬不絕，朵顏衛伯彥打來背叛南走，在白馬關北邊被都隆森格困收服。
《盧龍塞略》說，朵顏衛兀良哈人“最者為其(指黃金家族)婿，虜酋歲至祭天，以往來其部落，而次則奉女為嬖只(即妣吉)”，其女“各分部人馬，其父兄反為所攝，而因親以居矣”。阿勒坦汗曾將女兒嫁給濟拉瑪(即者勒蔑)十世孫猛古歹之子為妻，都隆森格也嫁女於炒為妻，他本人則娶朵顏衛兀良哈之女為妻，計有大嬖只、小嬖只、寶兔嬖只，另在駐牧於滴水崖附近的車雞達部還娶有兩位嬖只。土默特部以姻親為紐帶，使朵顏衛兀良哈之猛可、猛古歹、幹抹禿、伯顏帖忽思、把兔孛羅、伯思哈兒、板卜等部附屬。土默特部首領則“或隨母妻，或因分管部夷，移來薊鎮邊外駐牧”，於是便在滿套兒(今豐寧縣)一帶形成了兀愛營。都隆森格汗之子安兔臺吉、朝兔臺吉、土刺兔臺吉、土力把兔合吉、擺言兔合吉、明暗合吉等均隨其母駐牧於該營。
都隆森格繼位後，安兔（即噶爾圖，亦作趕兔)成為兀愛營的首領。據載，與此同時，蒙古勒津數萬部眾亦東徙，與噶爾圖一起遊牧。1615年(萬曆四十三年)噶爾圖去世，其子鄂木布楚琥爾領有兀愛營部眾。1627年(天啟七年)，林丹汗西進，擊喀喇沁、土默特等部。第二年鄂木布楚琥爾與喀喇沁的蘇布地聯合土默特等部，曾敗林丹汗於土默特之趙城，、蘇在歸途中再敗林丹汗赴張家ロ請賞之兵3千。其後木布楚琥爾為避察哈爾部之威脅，遂同善巴、蘇布地等歸附後金，受皇大板之命遷居於朝陽、阜新地區。1636年左右(崇德初年)，清廷編鄂木布楚琥爾所部為97佐領，設土默特右翼旗;編善巴所部為80佐領，設土默特左翼旗，以其屬民多為蒙古勒津人，故而習稱蒙古勒津旗(蒙古貞)。以上兩旗即東土默特。
(四)阿勒坦汗以後的土特部
1582年初(萬曆九年十二月)阿勒坦汗病逝，都隆森格洪臺吉繼位，號乞慶哈(即徹辰汗)。阿勒坦汗在世時，三娘子已“自練兵萬人”，加之都隆森格汗“老病”，故而“夷情向背，半系(三)娘子”。1583年(萬曆十ー年)，大成臺吉(即把漢那吉)墜馬而亡，三娘子“見大成比妓擁俺答所遺諸部落及板升甚雄”，謀欲為其子博達錫哩(即不他失禮)娶之，以取得對板升及其人眾的管轄權。此舉受到以恰臺吉為首的阿勒坦汗諸諾延的反對。在恰臺吉主持下，都隆森格汗之長子扯力克(即楚魯克)洪臺吉與大成比吉合婚，於是三娘子大怒，調集精兵進攻恰臺吉，雙方在大板升展開激戰。爾多斯徹辰洪臺吉和擺腰、兀慎諸部首領為之調解，三娘子不從，“誓以死相仇殺”，內訌達三年有餘。《萬曆武功錄·黃臺吉列傳》載，“三娘子擁精兵”，乞慶哈“威令不行”，“諸部曲及板升多有欲窺隙而起者，殆非俺答沕時之景也”。
1586年1月(萬曆十年十ニ月)都隆森格汗病逝，三娘子堅握順義王印及兵符，欲其子博達錫哩為王，因而與扯力克洪臺吉再次發生衝突，明朝擔心危及封疆，致羈縻政策失敗，遂由宣大總督出面干涉，促成扯力克與三娘子合婚。最後，扯力克襲授順義王爵，三娘子封為忠順夫人，其子博達錫哩升授龍虎將軍，並娶大成比吉為妻，土默特內訌告一段落。
扯力克汗“為人強而習於計”，控弦之士動以萬數，繼位後，曾於1590年(萬曆十八年)在甘肅一帶與明朝發生衝突。自1591年率部回到土默川之後再無大舉。其晚年，據《武備志》載:“沉緬昏眊，凡應酬番漢事務，委三娘子理之。”17世紀初，博達錫哩與大成比吉所生之子素囊(蘇都那木)富有板升，掌握西部(今土默川一帶)兵權，カ量雄於諸部。1607年(萬曆三十五年)扯力克汗去世，其長孫博碩克圖(即ト石兔)應襲王爵，素囊憑恃三娘子愛孫的身份，圖謀據王位，宣稱:“應王者我也”，阻撓博碩克圖襲爵達6年之久。1611年(萬曆三十九年)，以五路臺吉(那木兒)為首的73家吉出面主持公道，擁博碩克圖襲爵。三娘子、素囊祖孫大修戰具，與五路臺吉等對抗，土默特部公開分裂。因明朝宣大總督塗宗出面幹旋，雙方未以兵戎相見。1612年(萬曆四十年)三娘子病故，到1614年(萬曆四十二年)博碩克圖始在各臺吉支援下承襲王爵，但兵權仍在素囊手中。《明實錄》載:博碩克圖“威今不行於素囊，而素囊抗衡ト酋”，“虜王失馭”。土默特部因此大大削弱。同時，喀喇沁部“自為一支”，鄂爾多斯濟農也稱汗號，他們的離異，使整個右翼也大大削弱。
1628年(崇禎元年)，林丹汗率軍西征，博碩克圖汗曾聯合鄂爾多斯、喀喇沁(蘇布地)、東土默特(鄂木布楚琥爾)等部抵抗，結果失敗。博碩克圖汗逃至爾多斯，不久死去。土默特部之“習令色以東西哨兵馬並豐州灘大小板升獻於插(哈爾)”(按，習令色大約就是素囊臺吉之子習令臺吉，該父子系博碩克圖汗的政敵)，部眾自此潰散。1632年(崇禎五年，天聰六年)，皇大極西征林丹汗，佔據默特地區，博碩克圖汗之子俄木布與古祿格、杭高、託博克等收集部眾，降附後金。
