很多人都說非腫瘤純生信沒有什麼內容可以做,難以發表SCI論文,其實並不是這樣的,你可以對分析內容進行一下創新,例如這樣的分析思路:
如何進行創新呢?
我們可以根據一篇2-3分的非腫瘤參考範文進行創新,例如下面這篇參考範文:
原文是這樣做的:
第一步,資料下載處理、合併、矯正、差異分析
第二步,進行WGCNA分析
第三步,進行取交集的基因
第四步,進行GO、KEGG富集分析、PPI分析、構建miRNA-mRNA-TF網路
第五步,進行免疫相關的分析
我們進行創新後的分析思路是這樣的:
第一步,資料下載處理、合併、矯正、差異分析
第二步,重點關注免疫分析部分,不做其他分析,CIBERSORT這種演算法估計審稿人都看膩了,我們使用ssGSEA演算法計算免疫評分,並且分為免疫細胞和免疫功能這兩部分
第三步,進行免疫細胞之間的相關性分析、免疫功能之間的相關性分析
第四步,進行正常組與疾病組之間免疫評分的差異分析
第五步,進行顯著表達的基因與免疫細胞、免疫功能的相關性分析,並且篩選與免疫最為相關的基因(重點分析內容)
第六步,選出與免疫最為相關的基因構建模型(重點分析內容)
第七步,GO與KEGG分析估計審稿人都看膩了,我們來做一下DO分析
在這裡我們僅僅分享了創新思路,裡面的操作內容需要大家自行進行摸索。