雖然秦始皇有統一六國的不世之功勳，但是其數項初心良好的政策卻直接導致了秦朝成為短命王朝。
一，虛內實外
秦朝自統一六國之後，開始繼續開疆拓土之路，北卻匈奴，南征百越，將大量的帝國精銳將士調往帝國的邊疆，從而在帝國內部卻只留下很少的治安力量，而由於這些新徵服的地方無法從經濟、人力等方面給帝國軍隊以支援，所以秦朝還不得不不斷地為邊疆輸送人力物力和財力。這些都導致了帝國內部越來越虛弱，以至於在陳勝吳廣大澤鄉起義的時候，秦朝不得不讓驪山修建陵墓的囚徒臨時組成軍隊去對抗起義軍。
二，拆城市城牆、關隘
根據歷史學家考證，秦朝在統一六國之後，為向天下人表示永遠和平、永無戰爭的決心，秦始皇下令拆掉了全國境內（除邊境以外）所有城市的城牆，其中就包括了秦都咸陽以及像函谷關這樣的關隘。
很明顯，這雖然在當時有很大的政治意義，但是其直接後果就是義軍領袖周章可以輕而易舉地攻入秦國腹地，打到驪山腳下。而由於沒有城牆，劉邦剛進入關中，秦王子嬰就向劉邦投降。
所以，秦始皇的思想明顯太過超前，以至於無法與現實相適應。其中無論是秦國先進的郡縣制的中央集權制度，還是秦帝國一統天下、凝聚民族核心的政策，它們都沒有起到很好的效果。
