12月2日,中國科學院昆明動物研究所陳勇彬課題組在《Molecular Cancer-影響因子:27.401》雜誌線上發表了題為“LncRNA PKMYT1AR promotes cancer stem cell maintenance in non-small cell lung cancer via activating Wnt signaling pathway”的研究論文。陳勇彬課題組長期利用遺傳進化與腫瘤學交叉學科的整合組學方法,篩選高原動物低氧適應的關鍵新基因,並解析其在低氧實體瘤中的功能與分子機制,研究成果作為通訊作者分別發表在Cell Research (2021)、Nature Communications (2018, 2019), National Science Review (2019)、Signal transduction and targeted therapy (2021a, 2021b)、Theranostics (2017, 2020)、Cancer Letters (2020) 和 Frontiers in cell and developmental cell (2021a,2021b)等期刊上。
陳勇彬課題組前期透過整合組學的分析方法,篩選得到在非小細胞肺癌(NSCLC)腫瘤幹細胞和順鉑化療耐藥細胞株中高表達的人類特異長鏈非編碼RNA(lncRNA),後根據該lncRNA能調控下游靶基因PKMYT1在NSCLC中的功能,給其命名為PKMYT1 associated lncRNA (PKMYT1AR)。研究結果顯示,PKMYT1AR在NSCLC受轉錄因子YY1調控,而YY1受低氧微環境誘導在NSCLC中高表達。臨床相關性分析結果顯示,PKMYT1AR在NSCLC的腫瘤組織與患者外周血的血清樣本中都高表達,其高表達與腫瘤患者的不良預後顯著正相關。體內和體外實驗研究發現,敲低PKMYT1AR表達能夠顯著抑制腫瘤細胞的生長。進一步研究發現PKMYT1AR能夠促進肺癌幹細胞的自我更新能力,提高腫瘤細胞對順鉑化療藥物的耐藥性。分子機制研究表明,PKMYT1AR主要定位在細胞質當中,其以分子海綿吸附效應(miRNA sponge)作用於miRNA-485-5p,上調miR-485-5p下游靶基因PKMYT1(細胞週期調控蛋白)的表達。PKMYT1促進腫瘤細胞增殖,並透過與E3泛素連線酶β-TrCP1競爭性地與Wnt訊號通路下游轉錄因子β-catenin蛋白結合,穩定β-catenin蛋白表達,啟用Wnt訊號通路和腫瘤幹細胞,進而推動NSCLC的惡性進展。研究團隊設計了靶向抑制PKMYT1AR表達的ASOs(反義寡核苷酸),並鑑定其能夠顯著抑制腫瘤細胞的體內外生長和遷移能力,提示PKMYT1AR未來可以被作為一個有潛力的NSCLC臨床診斷和治療的新靶點。
該項工作陳勇彬和楊翠萍研究員為論文的共同通訊作者,中科院昆明動物所的何姚梅博士,蔣秀林博士和昆明醫科大學第三附屬醫院的段林燦博士,為該論文的共同第一作者。該工作得到了國家重點研發計劃,中科院先導專項和國家自然科學基金等專案的資助。 (圖片來源:中國科學院昆明動物研究所)